Phytophthoraの小さなセルロース結合ドメインタンパク質（CBD1）は、非結合アミノ末端で非常に多様です。

小さなセルロース結合ドメインタンパク質CBD1は、植物の病原性ストラメノパイル植物球のインフタンのセルロース細胞壁にしっかりと結合しています。ジャガイモ植物におけるタンパク質の導入遺伝子発現も、植物細胞壁への結合を示しました。世界のコレクションからのP.インフェスタンの47個の分離株を使用して、17の他の植物球種および関連する病原体形質菌Halstediiを使用して研究が実施され、重要な細胞壁タンパク質がアミノ酸の変動にさらされるかどうかを判断しました。P.インフェスタン分離株によってコードされるCBD 1の分泌部分のアミノ酸配列内で、30は互いに同一であり、P。mirabilisと同一でした。4つの分離株には1つのアミノ酸差があり、それぞれ異なる場所にあり、1つの分離株には2つのアミノ酸置換がありました。残りの13個の分離株には、それぞれ同一の位置（D17/g、d31/g、i32/s、t43/a、およびg50/a）にある5つのアミノ酸変化があり、単一の起源を示唆しています。P. infestans cbd1と他の植物球種の比較では、タンパク質のアミノ末端での60アミノ酸間の広範なアミノ酸の変動と、重要なセルロース結合ドメイン配列が始まるG61からの高レベルの保存が終わりまで特定されました。タンパク質の（L110）。セルロースに結合する必要がある領域は保存されていますが、他の細胞壁成分と相互作用するために利用可能な領域はかなりの変動の影響を受けます。これは、関連するPlasmopara属でさえ明らかな特徴です。特定の変更と種間関連性の決定には、特定の変更を使用できます。この情報の適用により、CBD1遺伝子の高度に保存された可変領域のプライマーを組み合わせることにより、P。infestansおよびP. sojaeのPCR検出のための種固有のプライマーの設計が可能になりました。

The small cellulose-binding-domain protein CBD1 is tightly bound to the cellulosic cell wall of the plant pathogenic stramenopile Phytophthora infestans. Transgene expression of the protein in potato plants also demonstrated binding to plant cell walls. A study was undertaken using 47 isolates of P. infestans from a worldwide collection, along with 17 other Phytophthora species and a related pathogen Plasmopara halstedii, to determine if the critical cell wall protein is subject to amino acid variability. Within the amino acid sequence of the secreted portion of CBD 1, encoded by the P. infestans isolates, 30 were identical with each other, and with P. mirabilis. Four isolates had one amino acid difference, each in a different location, while one isolate had two amino acid substitutions. The remaining 13 isolates had five amino acid changes that were each in identical locations (D17/G, D31/G, I32/S, T43/A, and G50/A), suggesting a single origin. Comparison of P. infestans CBD1 with other Phytophthora species identified extensive amino acid variation among the 60 amino acids at the amino terminus of the protein, and a high level of conservation from G61, where the critical cellulose-binding domain sequences begin, to the end of the protein (L110). While the region needed to bind to cellulose is conserved, the region that is available to interact with other cell wall components is subject to considerable variation, a feature that is evident even in the related genus Plasmopara. Specific changes can be used in determining intra- and inter-species relatedness. Application of this information allowed for the design of species-specific primers for PCR detection of P. infestans and P. sojae, by combining primers from the highly conserved and variable regions of the CBD1 gene.