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Luffa Cylindrica（L.）Roem。中国の経済的に重要な野菜作物です。ただし、この種のゲノム情報は現在不明です。この研究では、L。cylindricaのゲノム調査が初めて行われ、次世代シーケンス（NGS）テクノロジーを使用して実施されました。合計で、L。cylindricaの43.40 GBシーケンスデータ、推定ゲノムサイズ789.97 MBの約54.94×カバレッジがHISEQ 2500シーケンスから得られ、グアニンプラスシトシン（GC）含有量が37.90％に計算されました。ゲノム配列のヘテロ接合性はわずか0.24％でした。合計で、525 bp n50の長さ525 bp n50および1,410,117の足場（> 200 bp）の1,913,731のコンティグ（> 200 bp）が885.01 MBの長さが得られました。最初の組み立てられたL. cylindricaゲノムから、431,234マイクロサテライト（SSR）（≥5リピート）が特定されました。SSRリピートのモチーフタイプには、62.88％ジヌクレオチド、31.03％のトリヌクレオチド、4.59％テトラヌクレオチド、0.96％ペンタヌクレオチド、0.54％ヘキサヌクレオチドが含まれていました。80のゲノムSSRマーカーが開発され、「Zheda 23」と「Zheda 83」の両方で51/80プライマーを使用できます。SSR-HRM分析を通じて、32のアクセッションの遺伝的多様性を調査するために、19のSSRを使用しました。非加重ペアグループメソッド分析（UPGMA）樹状図は、SSR-HRM RAWデータを計算することにより構築されました。SSR-HRMは、Luffa種の遺伝子型関係分析に効果的に使用できます。
Luffa Cylindrica（L.）Roem。中国の経済的に重要な野菜作物です。ただし、この種のゲノム情報は現在不明です。この研究では、L。cylindricaのゲノム調査が初めて行われ、次世代シーケンス（NGS）テクノロジーを使用して実施されました。合計で、L。cylindricaの43.40 GBシーケンスデータ、推定ゲノムサイズ789.97 MBの約54.94×カバレッジがHISEQ 2500シーケンスから得られ、グアニンプラスシトシン（GC）含有量が37.90％に計算されました。ゲノム配列のヘテロ接合性はわずか0.24％でした。合計で、525 bp n50の長さ525 bp n50および1,410,117の足場（> 200 bp）の1,913,731のコンティグ（> 200 bp）が885.01 MBの長さが得られました。最初の組み立てられたL. cylindricaゲノムから、431,234マイクロサテライト（SSR）（≥5リピート）が特定されました。SSRリピートのモチーフタイプには、62.88％ジヌクレオチド、31.03％のトリヌクレオチド、4.59％テトラヌクレオチド、0.96％ペンタヌクレオチド、0.54％ヘキサヌクレオチドが含まれていました。80のゲノムSSRマーカーが開発され、「Zheda 23」と「Zheda 83」の両方で51/80プライマーを使用できます。SSR-HRM分析を通じて、32のアクセッションの遺伝的多様性を調査するために、19のSSRを使用しました。非加重ペアグループメソッド分析（UPGMA）樹状図は、SSR-HRM RAWデータを計算することにより構築されました。SSR-HRMは、Luffa種の遺伝子型関係分析に効果的に使用できます。
Luffa cylindrica (L.) Roem. is an economically important vegetable crop in China. However, the genomic information on this species is currently unknown. In this study, for the first time, a genome survey of L. cylindrica was carried out using next-generation sequencing (NGS) technology. In total, 43.40 Gb sequence data of L. cylindrica, about 54.94× coverage of the estimated genome size of 789.97 Mb, were obtained from HiSeq 2500 sequencing, in which the guanine plus cytosine (GC) content was calculated to be 37.90%. The heterozygosity of genome sequences was only 0.24%. In total, 1,913,731 contigs (>200 bp) with 525 bp N50 length and 1,410,117 scaffolds (>200 bp) with 885.01 Mb total length were obtained. From the initial assembled L. cylindrica genome, 431,234 microsatellites (SSRs) (≥5 repeats) were identified. The motif types of SSR repeats included 62.88% di-nucleotide, 31.03% tri-nucleotide, 4.59% tetra-nucleotide, 0.96% penta-nucleotide and 0.54% hexa-nucleotide. Eighty genomic SSR markers were developed, and 51/80 primers could be used in both "Zheda 23" and "Zheda 83". Nineteen SSRs were used to investigate the genetic diversity among 32 accessions through SSR-HRM analysis. The unweighted pair group method analysis (UPGMA) dendrogram tree was built by calculating the SSR-HRM raw data. SSR-HRM could be effectively used for genotype relationship analysis of Luffa species.
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