有毒キノコのアマトキシンとファロトキシンをコードする遺伝子を同定するための普遍的な方法

背景：現在知られている診断DNA標的は、有毒なキノコの検出のためにPCRアッセイで増幅されているため、食用種の対応物を持っているため、毒マッシュルームでのみ発生するアマニチンとファロトキシンをコードする遺伝子に特有のPCRプライマーを設計する必要があります。 目的：この研究の目的は、肝毒性環状ペプチドをコードするすべての遺伝子を検出するためのPCRベースの方法のテストでした - 最も危険な有毒キノコに存在するアマニチンとファロトキシン。 材料と方法：PCRの変性プライマーは、国立バイオテクノロジー情報センターのGenbankに堆積した18種の有毒キノコのアマニチン（n = 13）およびファロトキシン（n = 5）遺伝子に基づいて設計されました。 結果：PCRアッセイの特異性は、9種の食用キノコ、デスキャップ-Amanita Phalloides、およびPanther Cap -Amanita Pantherinaに対して確認されました。 結論：アマニチンとファロトキシン遺伝子に固有のPCRプライマーの2つのカップルを設計すると、アマニタファロイドおよび肝毒性環状ペプチド - アマニチンとファロトキシンを産生する他のキノコ種の検出に推奨できます。

BACKGROUND: As the currently known diagnostic DNA targets amplified in the PCR assays for detection of poisonous mushrooms have their counterparts in edible species, there is a need to design PCR primers specific to the genes encoding amanitins and phallotoxins, which occur only in poisonous mushrooms. OBJECTIVE: The aim of the study was testing of PCR-based method for detection of all genes encoding hepatotoxic cyclic peptides - amanitins and phallotoxins present in the most dangerous poisonous mushrooms. MATERIAL AND METHODS: Degenerate primers in the PCR were designed on the basis of amanitins (n=13) and phallotoxins (n=5) genes in 18 species of poisonous mushrooms deposited to Genbank of the National Center for Biotechnology Information. RESULTS: The specificity of the PCR assays was confirmed against 9 species of edible mushrooms, death cap - Amanita phalloides and panther cap - Amanita pantherina. CONCLUSIONS: Designed two couples of PCR-primers specific to amanitins and phallotoxins genes can be recommended for detection of Amanita phalloides and other mushroom species producing hepatotoxic cyclic peptides - amanitins and phallotoxins.