公衆衛生の重要性のカンピロバクターsppの迅速な識別におけるMaldi-tof MSシステムの適用

カンピロバクテリア症は、カンピロバクター属によって引き起こされる感染性胃腸疾患です。ほとんどの場合、診断不良と限られたデータベースのために、診断または過少報告されています。16SリボソームRNA（RRNA）配列タイピングを含むいくつかのDNAベースの分子診断技術は、カンピロバクターの種同定に広く使用されています。それにもかかわらず、これらのアッセイは時間がかかり、高品質の細菌DNAが必要です。マトリックス支援レーザー脱着イオン化（MALDI）飛行時間（TOF）MSは、抽出や精製なしで無傷の細胞を使用して微生物の迅速な識別を提供できる新興診断技術です。この研究では、16のカンピロバクター属の24のアメリカ型文化コレクションリファレンス分離株を分析しました。2つの市販のMADI-TOF MSプラットフォーム、つまりBiomérieux®MSおよびBruker Biotyperシステムを利用して、迅速に識別するための5つの未知の臨床細菌分離株。さらに、未知の臨床分離株の種レベルの同定を確認するために、16S RRNAシーケンスを実施しました。MALDI-TOF MSシステムの両方が、C。Jejuni、C。coli、C。Lari、およびC. fetusの分離株を特定しました。この研究の結果は、MALDI-TOF MS技術がカンピロバクター属の同定に使用できることを示唆しています。公衆衛生の重要性。

Campylobacteriosis is an infectious gastrointestinal disease caused by Campylobacter spp. In most cases, it is either underdiagnosed or underreported due to poor diagnostics and limited databases. Several DNA-based molecular diagnostic techniques, including 16S ribosomal RNA (rRNA) sequence typing, have been widely used in the species identification of Campylobacter. Nevertheless, these assays are time-consuming and require a high quality of bacterial DNA. Matrix-assisted laser desorption ionization (MALDI) time-of-flight (TOF) MS is an emerging diagnostic technology that can provide the rapid identification of microorganisms by using their intact cells without extraction or purification. In this study, we analyzed 24 American Type Culture Collection reference isolates of 16 Campylobacter spp. and five unknown clinical bacterial isolates for rapid identification utilizing two commercially available MADI-TOF MS platforms, namely the bioMérieux VITEK® MS and Bruker Biotyper systems. In addition, 16S rRNA sequencing was performed to confirm the species-level identification of the unknown clinical isolates. Both MALDI-TOF MS systems identified the isolates of C. jejuni, C. coli, C. lari, and C. fetus. The results of this study suggest that the MALDI-TOF MS technique can be used in the identification of Campylobacter spp. of public health importance.