グループB StreptococcusのPilus Island 1バックボーンタンパク質の新規バリアントの遺伝的証拠

目的：PILIは、宿主細胞の接着と浸潤を促進することにより、グループB連鎖球菌（GBS）の感染の病因に大きく貢献します。GBSピリンサブユニット（バックボーンピリンタンパク質、BP、および補助的なピリンタンパク質、AP）、およびPilusアセンブリに必要な特定の酵素は、Pilus Island 1（PI-1）およびPI-2として知られる2つの別々のゲノム領域にある遺伝子によってエンコードされます。私たちの目的は、カナダのメトロポリタン・トロントからのGBS分離株のコレクションのPILUSプロファイルを特徴付けることでした。 方法論：1332の侵襲的およびコロニーGBS分離株のPilusプロファイルは、PCRによって、選択された場合、全ゲノムシーケンスによって決定されました。 結果：GBS生物のコレクションのPILUSプロファイルを調査している間、51個の分離株がBP-1Bと名付けたPI-1 BPの新しいバリアントを所有していることを発見しました。典型的なGBS BP-1の予測された翻訳されたシーケンスと新規BP-1Bバリアントは、63％のアミノ酸配列相同性のみを共有しました。新規BP-1Bバリアントは、血清型IBおよびVIの株の間で最も一般的でしたが、血清型IA、II、III、VIIIの株の間でも見られました。 結論：一般的に使用されるマルチプレックスPCRスキームでは検出できない新しいPi-1 BPの比較的頻繁に発生することを説明します。Multiplex PCRアッセイに簡単に組み込むことができるPCRプライマーを提示して、新規BP-1Bバリアントの株を識別します。

PURPOSE: Pili contribute significantly to the pathogenesis of infection of group B Streptococcus (GBS) by facilitating adhesion and invasion of host cells. GBS pilin subunits (the backbone pilin protein, BP, and the ancillary pilin proteins, AP) as well as the specific enzymes required for pilus assembly are encoded by genes located in two separate genomic regions, known as pilus island 1 (PI-1) and PI-2. Our aim was to characterize the pilus profile of a collection of GBS isolates from metropolitan Toronto, Canada. METHODOLOGY: The pilus profile of 1332 invasive and colonizing GBS isolates was determined by PCR and, in selected cases, by whole genome sequencing. RESULTS: While investigating the pilus profile of a collection of GBS organisms, we discovered that 51 isolates possessed a novel variant of the PI-1 BP, which we named BP-1b. The predicted translated sequences of archetypical GBS BP-1 and novel BP-1b variants shared only 63 % amino acid sequence homology. The novel BP-1b variant was most common among strains of serotype Ib and VI, but was also found among strains of serotypes Ia, II, III and VIII. CONCLUSION: We describe a relatively frequent occurrence of a novel PI-1 BP that cannot be detected by a commonly used multiplex PCR scheme, which could lead to strains being mistyped as PI-1 negative. We present PCR primers that can easily be incorporated into the multiplex PCR assay to identify strains with novel BP-1b variant.