Biospear：ペナルティ化されたコックス回帰におけるバイオマーカー選択のためのRパッケージ

概要：RパッケージBiospearは、生存率と高次元COXモデルの治療効果に最も強い影響を与えるバイオマーカーを選択し、予想される生存確率を推定することができます。実装されたアプローチのほとんどは、ペナルティを受けた回帰手法に基づいています。 可用性と実装：パッケージはCRANで利用できます。（https://cran.r-project.org/package = biospear）。 連絡先：stefan.michiels@gustaveroussy.fr。 補足情報：補足データは、バイオインフォマティクスオンラインで入手できます。

SUMMARY: The R package biospear allows selecting the biomarkers with the strongest impact on survival and on the treatment effect in high-dimensional Cox models, and estimating expected survival probabilities. Most of the implemented approaches are based on penalized regression techniques. AVAILABILITY AND IMPLEMENTATION: The package is available on the CRAN. (https://CRAN.R-project.org/package=biospear). CONTACT: stefan.michiels@gustaveroussy.fr. SUPPLEMENTARY INFORMATION: Supplementary data are available at Bioinformatics online.