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マトリックスメタロプロテイナーゼ-9（MMP-9）は、急性皮膚炎症に重要な役割を果たすようです。テトラサイクリンの亜抗菌線量は、MMP-9タンパク質の活性を阻害することが実証されています。ただし、長期使用テトラサイクリンは副作用を誘発します。MMP-9の触媒部位は、亜鉛結合アミノ酸、His401、His405、およびHis411にあります。インシコ研究を使用して、伝統的な漢方薬（TCM）データベースのMMP-9阻害剤として新しい医学式を検索しようとしました。ハイスループット仮想スクリーニングを利用して、どの天然化合物が亜鉛結合部位に結合できるかを見つけました。MMP-9阻害剤とその活性の足場によって構築された定量的構造活性関係（QSAR）モデルは、MMP-9の天然化合物の生物活性を予測するために採用されました。結果は、Celacinnine、Lobelanidine、およびCelallocinnineが亜鉛結合部位と相互作用する資格があり、適切に予測活性を示したことを示しました。安定した相互作用が動的条件下で観察されたため、CelallocinnineがMMP-9の亜鉛ビンギング部位に最適なTCM化合物であることがわかりました。さらに、CelacinnineとLobelanidineは、薬物標的相互作用ネットワーク分析によって同定されたMMP-9関連タンパク質と相互作用する可能性があります。したがって、私たちは、ハーブハーブリカムパトゥルム、セダムエーカー、およびセラロキニン、セラシニン、ロベラニジンを含むトリプリテリージウムwilfordiiを提案しました。
マトリックスメタロプロテイナーゼ-9（MMP-9）は、急性皮膚炎症に重要な役割を果たすようです。テトラサイクリンの亜抗菌線量は、MMP-9タンパク質の活性を阻害することが実証されています。ただし、長期使用テトラサイクリンは副作用を誘発します。MMP-9の触媒部位は、亜鉛結合アミノ酸、His401、His405、およびHis411にあります。インシコ研究を使用して、伝統的な漢方薬（TCM）データベースのMMP-9阻害剤として新しい医学式を検索しようとしました。ハイスループット仮想スクリーニングを利用して、どの天然化合物が亜鉛結合部位に結合できるかを見つけました。MMP-9阻害剤とその活性の足場によって構築された定量的構造活性関係（QSAR）モデルは、MMP-9の天然化合物の生物活性を予測するために採用されました。結果は、Celacinnine、Lobelanidine、およびCelallocinnineが亜鉛結合部位と相互作用する資格があり、適切に予測活性を示したことを示しました。安定した相互作用が動的条件下で観察されたため、CelallocinnineがMMP-9の亜鉛ビンギング部位に最適なTCM化合物であることがわかりました。さらに、CelacinnineとLobelanidineは、薬物標的相互作用ネットワーク分析によって同定されたMMP-9関連タンパク質と相互作用する可能性があります。したがって、私たちは、ハーブハーブリカムパトゥルム、セダムエーカー、およびセラロキニン、セラシニン、ロベラニジンを含むトリプリテリージウムwilfordiiを提案しました。
Matrix metalloproteinase-9 (MMP-9) appears to play an important role in acute skin inflammation. Subantimicrobial dose of tetracycline has been demonstrated to inhibit the activity of MMP-9 protein. However, long-term use tetracycline will induce side effect. The catalytic site of MMP-9 is located at zinc-binding amino acids, His401, His405 and His411. We attempted to search novel medicine formula as MMP-9 inhibitors from traditional Chinese medicine (TCM) database by using in silico studies. We utilized high-throughput virtual screening to find which natural compounds could bind to the zinc-binding site. The quantitative structure-activity relationship (QSAR) models, which constructed by scaffold of MMP-9 inhibitors and its activities, were employed to predict the bio-activity of the natural compounds for MMP-9. The results showed that Celacinnine, Lobelanidine and Celallocinnine were qualified to interact with zinc-binding site and displayed well predictive activity. We found that celallocinnine was the best TCM compound for zinc binging sites of MMP-9 because the stable interactions were observed under dynamic condition. In addition, Celacinnine and Lobelanidine could interact with MMP-9 related protein that identified by drug-target interaction network analysis. Thus, we suggested the herbs Hypericum patulum, Sedum acre, and Tripterygium wilfordii that containing Celallocinnine, Celacinnine and Lobelanidine might be a novel medicine formula to avoid the side effect of tetracycline and increase the efficacy of treatment.
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