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背景：ブラストサチスは、人間の胃腸管に見られるコスモポリタンな原生生物寄生虫であり、発展途上国で非常に普及しています。最近の分子研究により、広範な遺伝的多様性が明らかになりました。これは、小型サブユニットリボソームRNA遺伝子の配列分析に基づいて、異なるサブタイプ（STS）に分類されています。胚盤胞はブラジルで最も一般的な糞便寄生虫の1つですが、サブタイプの多様性は国内では不明のままです。この研究の目的は、ブラジルのリオデジャネイロにあるデュケデカクシアスにある都市コミュニティにおけるブラストシスティスSTの分布を決定することを目的としています。 方法：Pavlovaの培地の胚盤胞の合計64個の便サンプルをPCRによってサブタイプ化し、系統発生分析と配列タグ付きサイト（STS）プライマーを使用したサブタイプ特異的PCRに加えて、小さなサブユニットRRNA遺伝子を標的とするプライマーを使用して配列決定しました。 結果：Endolimax Nana（14％）、Entamoeba Complex（10.5％）、Taenia sp。（0.6％）、Trichuris trichiura（1.3％）およびEnterobius vermicularis（1.3％）は、胚盤胞陽性サンプルで検出されました。PCR/DNAシーケンスでテストされた64のサンプルのうち、55はST1（42％）、ST3（49％）、ST2（7％）およびST4（2％）、および混合ST（ST1+ST3）の存在として識別されました。感染は9つのサンプル（14％）で検出されました。 結論：ブラジルの胚盤胞分離株のDNA配列決定と系統解析により、4つの異なるサブタイプが特定されました。私たちの知る限り、この研究は、ブラジルのリオ・デ・ジャネイロの都市部における胚盤胞のサブタイプの最初の遺伝的特性を提供しました。また、ブラジルで初めてST4を特定しました。リオデジャネイロのヒト集団全体のSTの分布を決定するには、さらなる研究が必要です。
背景：ブラストサチスは、人間の胃腸管に見られるコスモポリタンな原生生物寄生虫であり、発展途上国で非常に普及しています。最近の分子研究により、広範な遺伝的多様性が明らかになりました。これは、小型サブユニットリボソームRNA遺伝子の配列分析に基づいて、異なるサブタイプ（STS）に分類されています。胚盤胞はブラジルで最も一般的な糞便寄生虫の1つですが、サブタイプの多様性は国内では不明のままです。この研究の目的は、ブラジルのリオデジャネイロにあるデュケデカクシアスにある都市コミュニティにおけるブラストシスティスSTの分布を決定することを目的としています。 方法：Pavlovaの培地の胚盤胞の合計64個の便サンプルをPCRによってサブタイプ化し、系統発生分析と配列タグ付きサイト（STS）プライマーを使用したサブタイプ特異的PCRに加えて、小さなサブユニットRRNA遺伝子を標的とするプライマーを使用して配列決定しました。 結果：Endolimax Nana（14％）、Entamoeba Complex（10.5％）、Taenia sp。（0.6％）、Trichuris trichiura（1.3％）およびEnterobius vermicularis（1.3％）は、胚盤胞陽性サンプルで検出されました。PCR/DNAシーケンスでテストされた64のサンプルのうち、55はST1（42％）、ST3（49％）、ST2（7％）およびST4（2％）、および混合ST（ST1+ST3）の存在として識別されました。感染は9つのサンプル（14％）で検出されました。 結論：ブラジルの胚盤胞分離株のDNA配列決定と系統解析により、4つの異なるサブタイプが特定されました。私たちの知る限り、この研究は、ブラジルのリオ・デ・ジャネイロの都市部における胚盤胞のサブタイプの最初の遺伝的特性を提供しました。また、ブラジルで初めてST4を特定しました。リオデジャネイロのヒト集団全体のSTの分布を決定するには、さらなる研究が必要です。
BACKGROUND: Blastocystis is a cosmopolitan protist parasite found in the human gastrointestinal tract and is highly prevalent in developing countries. Recent molecular studies have revealed extensive genetic diversity, which has been classified into different subtypes (STs) based on sequence analysis of small subunit ribosomal RNA gene. Blastocystis is one of the most common fecal parasites in Brazil, but the diversity of subtypes remains unknown in the country. This study aimed to determine the distribution of Blastocystis STs in an urban community in Duque de Caxias, Rio de Janeiro, Brazil. METHODS: A total of 64 stool samples positive for Blastocystis in Pavlova's medium were subtyped by PCR and sequenced using primers targeting the small subunit rRNA gene, in addition to phylogenetic analysis and subtype-specific PCR using sequence-tagged-site (STS) primers. RESULTS: Endolimax nana (14%), Entamoeba complex (10.5%), Taenia sp. (0.6%), Trichuris trichiura (1.3%) and Enterobius vermicularis (1.3%) were detected in Blastocystis-positive samples. Of the 64 samples tested by PCR/DNA sequencing, 55 were identified as ST1 (42%), ST3 (49%), ST2 (7%) and ST4 (2%), and the presence of mixed ST (ST1 + ST3) infection was detected in nine samples (14%). CONCLUSIONS: DNA sequencing and phylogenetic analysis of Brazilian Blastocystis isolates identified four different subtypes. To our knowledge, this study provided the first genetic characterization of Blastocystis subtypes in an urban area of Rio de Janeiro, Brazil. We also identified ST4 for the first time in Brazil. Further studies are necessary to determine the distribution of STs across human populations in Rio de Janeiro.
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