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Critical reviews in biotechnology2018Aug01Vol.38issue(5)

Streptomyces SPは、HCH異性体の生分解のための強力なバイオテクノロジーツールです:生化学的および分子基盤

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文献タイプ:
  • Journal Article
  • Review
概要
Abstract

アクチノバクテリアは、有機塩化物農薬を耐えられ、除去する能力を持つ有毒物質のよく知られている劣化者です。したがって、それらはバイオレメディエーションに使用されます。アクチノバクテリアによる有機塩素の生分解は、純粋および混合培養で実証されており、γ-ペンタクロロシクロヘキセン(γ-PCCH)を含む代謝性中間体の付随的な産生があります。1,3,4,6-テトラクロロ-1,4-シクロヘキサジエン(1,4-TCDN);1,2-ジクロロベンゼン(1,2-DCB)、1,3-ジクロロベンゼン(1,3-DCB)、または1,4-ジクロロベンゼン(1,4-DCB);1,2,3-トリクロロベンゼン(1,2,3-TCB)、1,2,4-トリクロロベンゼン(1,2,4-TCB)、または1,3,5-トリクロロベンゼン(1,3,5-TCB));1,3-DCB;および1,2-DCB。質量分析検出、特にGC-MSと結合したクロマトグラフィーは、通常、HCH異性体代謝物を決定するために使用されます。HCH異性体分解代謝経路に関与する重要な酵素には、ヘキサクロロシクロヘキサンデヒドロクロリナーゼ(LINA)、ハロアルカンデハロゲナーゼ(LINB)、およびアルコールデヒドロゲナーゼ(LINC)が含まれます。これらの酵素の代謝的汎用性は知られています。リンによってコードされるアクチノバクテリアハロアルカンデヒドロゲナーゼの同定において進歩がなされています。この知識により、アクチノバクテリアを使用した生分解プロセスの将来の改善が可能になります。これらのプロセスに関与する分子メカニズムの酵素的および遺伝的特性は、完全に解明されておらず、さらなる研究が必要です。この分野での新しい進歩は、有望な結果を示唆しています。この論文の範囲には、次のものが含まれます。(i)ヘキサクロロシクロヘキサン(HCH)異性体の好気性分解経路。(ii)HCH異性体分解の代謝経路に関与する重要な遺伝子と酵素。(iii)質量分析(GC-MS)に結合したガスクロマトグラフィーを介した中間代謝産物の同定と定量化。

アクチノバクテリアは、有機塩化物農薬を耐えられ、除去する能力を持つ有毒物質のよく知られている劣化者です。したがって、それらはバイオレメディエーションに使用されます。アクチノバクテリアによる有機塩素の生分解は、純粋および混合培養で実証されており、γ-ペンタクロロシクロヘキセン(γ-PCCH)を含む代謝性中間体の付随的な産生があります。1,3,4,6-テトラクロロ-1,4-シクロヘキサジエン(1,4-TCDN);1,2-ジクロロベンゼン(1,2-DCB)、1,3-ジクロロベンゼン(1,3-DCB)、または1,4-ジクロロベンゼン(1,4-DCB);1,2,3-トリクロロベンゼン(1,2,3-TCB)、1,2,4-トリクロロベンゼン(1,2,4-TCB)、または1,3,5-トリクロロベンゼン(1,3,5-TCB));1,3-DCB;および1,2-DCB。質量分析検出、特にGC-MSと結合したクロマトグラフィーは、通常、HCH異性体代謝物を決定するために使用されます。HCH異性体分解代謝経路に関与する重要な酵素には、ヘキサクロロシクロヘキサンデヒドロクロリナーゼ(LINA)、ハロアルカンデハロゲナーゼ(LINB)、およびアルコールデヒドロゲナーゼ(LINC)が含まれます。これらの酵素の代謝的汎用性は知られています。リンによってコードされるアクチノバクテリアハロアルカンデヒドロゲナーゼの同定において進歩がなされています。この知識により、アクチノバクテリアを使用した生分解プロセスの将来の改善が可能になります。これらのプロセスに関与する分子メカニズムの酵素的および遺伝的特性は、完全に解明されておらず、さらなる研究が必要です。この分野での新しい進歩は、有望な結果を示唆しています。この論文の範囲には、次のものが含まれます。(i)ヘキサクロロシクロヘキサン(HCH)異性体の好気性分解経路。(ii)HCH異性体分解の代謝経路に関与する重要な遺伝子と酵素。(iii)質量分析(GC-MS)に結合したガスクロマトグラフィーを介した中間代謝産物の同定と定量化。

Actinobacteria are well-known degraders of toxic materials that have the ability to tolerate and remove organochloride pesticides; thus, they are used for bioremediation. The biodegradation of organochlorines by actinobacteria has been demonstrated in pure and mixed cultures with the concomitant production of metabolic intermediates including γ-pentachlorocyclohexene (γ-PCCH); 1,3,4,6-tetrachloro-1,4-cyclohexadiene (1,4-TCDN); 1,2-dichlorobenzene (1,2-DCB), 1,3-dichlorobenzene (1,3-DCB), or 1,4-dichlorobenzene (1,4-DCB); 1,2,3-trichlorobenzene (1,2,3-TCB), 1,2,4-trichlorobenzene (1,2,4-TCB), or 1,3,5-trichlorobenzene (1,3,5-TCB); 1,3-DCB; and 1,2-DCB. Chromatography coupled to mass spectrometric detection, especially GC-MS, is typically used to determine HCH-isomer metabolites. The important enzymes involved in HCH isomer degradation metabolic pathways include hexachlorocyclohexane dehydrochlorinase (LinA), haloalkane dehalogenase (LinB), and alcohol dehydrogenase (LinC). The metabolic versatility of these enzymes is known. Advances have been made in the identification of actinobacterial haloalkane dehydrogenase, which is encoded by linB. This knowledge will permit future improvements in biodegradation processes using Actinobacteria. The enzymatic and genetic characterizations of the molecular mechanisms involved in these processes have not been fully elucidated, necessitating further studies. New advances in this area suggest promising results. The scope of this paper encompasses the following: (i) the aerobic degradation pathways of hexachlorocyclohexane (HCH) isomers; (ii) the important genes and enzymes involved in the metabolic pathways of HCH isomer degradation; and (iii) the identification and quantification of intermediate metabolites through gas chromatography coupled to mass spectrometry (GC-MS).

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