リジン2-ヒドロキシ酸性肥料のプロテオーム全体の同定は、Physcomitrella Patensの保存された新規ヒストンの修飾を明らかにしています

タンパク質リジン2-ヒドロキシソビューリル化（Khib）は、動物および酵母細胞に見られる新しく同定された翻訳後修飾です。以前の研究では、ヒストンKhibがオスの細胞分化に関与しており、動物のクロマチン機能の調節に重要な役割を果たすことが示唆されました。ただし、植物のタンパク質Khibに関する情報はまだ限られています。この研究では、特定の抗体およびLC-MS/MSメソッドを使用して、Physcomitrella Patensの3,001タンパク質の11,976 Khibサイトを特定しました。バイオインフォマティクス分析は、これらのKhib変更されたタンパク質が広範囲の分子機能と細胞プロセスに関与していることを示し、多様な細胞内局在を示しました。さらに、ヒト、マウス、P。patensのヒストンタンパク質中のKhib部位の比較は、H3およびH4ヒストンタンパク質の保存部位と、H1、H2AおよびH2Bヒストンタンパク質のP. patensの新規部位を発見しました。これは、植物におけるKhib翻訳後修飾に関する最初の報告であり、この研究は、ヒストンのKhibサイトとPhyscomitrella Patensの非ヒストンタンパク質の包括的なプロファイルを提供します。

Protein lysine 2-hydroxyisobutyrylation (Khib) is a newly identified post-translational modification found in animal and yeast cells. Previous research suggested that histone Khib is involved in male cell differentiation and plays a critical role in the regulation of chromatin functions in animals. However, information regarding protein Khib in plants is still limited. In this study, using a specific antibody and LC-MS/MS methods, we identified 11,976 Khib sites in 3,001 proteins in Physcomitrella patens. The bioinformatics analysis indicated that these Khib-modified proteins were involved in a wide range of molecular functions and cellular processes, and showed diverse subcellular localizations. Furthermore, an comparism of Khib sites in histone proteins among human, mouse and P. patens found conserved sites in the H3 and H4 histone proteins and novel sites in H1, H2A and H2B histone proteins in P. patens. This is the first report on Khib post-translational modifications in plants, and the study provides a comprehensive profile of Khib sites in histone and non-histone proteins in Physcomitrella patens.