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目的：腸球菌糞便（EFM）を人間の感染症を引き起こす能力を識別するための基準は、現在、欧州食品安全局（EFSA）によって議論されています。アンピシリンのマイクが2 mg/L以下で、IS16/ESP/HYL遺伝子がない株は、コミュニティEFMの推定毒性マーカー（PVM）分布に関する知識がないにもかかわらず、動物栄養の飼料添加物として使用するのに安全であると見なされるべきです。大規模なEFMコレクションにおける主要なPVMおよびアンピシリン表現型の分布を分析して、公衆衛生の観点からの株の安全性をさらに調査しました。 方法：異なる起源からクローン異種EFM（n = 328; 1986-2015）の間のPCR/シーケンスによって33個のPVMを評価しました。Eucastのガイドライン、クローン関係（MLST）、およびPVMのゲノム位置（S1-PFGE/ハイブリダイゼーション）に従って、アンピシリン感受性（ETEST/BROTH微量希釈）を分析しました。 結果：感染由来のEFMはPVMにより濃縮され、アンピシリンMICの増加は異なるPVMの濃縮と正の相関がありました。表面（ESP/SGRA/ECBA/完全ACM）およびピリタンパク質のPVMコード、またはコロニー形成（HYL/PTSD/ORF1481）または可塑性（IS16）を強化する他のPVMは、臨床EFM（主にクレードA1）と強く関連していましたが、クレードA2/Bでも異なる程度で観察されました。PTSDは、アンピシリン耐性EFMの優れたマーカーでした。PTSD、IS16、ORF1481、SGRA、および完全なPILI遺伝子クラスターの病院バリアントは、EFM株の安全性を評価するためのマーカーとして提案されています。 結論：私たちの研究は、多様なEFM系統におけるPVMの分布について拡大し、EFSAのEFM安全基準のリストに以前は含まれていなかったPVMの感染由来株の濃縮を実証しています。関連するEFM感染マーカーの証拠は、異なる公衆衛生の文脈におけるEFM株のリスク評価に影響を与える可能性があります。
目的：腸球菌糞便（EFM）を人間の感染症を引き起こす能力を識別するための基準は、現在、欧州食品安全局（EFSA）によって議論されています。アンピシリンのマイクが2 mg/L以下で、IS16/ESP/HYL遺伝子がない株は、コミュニティEFMの推定毒性マーカー（PVM）分布に関する知識がないにもかかわらず、動物栄養の飼料添加物として使用するのに安全であると見なされるべきです。大規模なEFMコレクションにおける主要なPVMおよびアンピシリン表現型の分布を分析して、公衆衛生の観点からの株の安全性をさらに調査しました。 方法：異なる起源からクローン異種EFM（n = 328; 1986-2015）の間のPCR/シーケンスによって33個のPVMを評価しました。Eucastのガイドライン、クローン関係（MLST）、およびPVMのゲノム位置（S1-PFGE/ハイブリダイゼーション）に従って、アンピシリン感受性（ETEST/BROTH微量希釈）を分析しました。 結果：感染由来のEFMはPVMにより濃縮され、アンピシリンMICの増加は異なるPVMの濃縮と正の相関がありました。表面（ESP/SGRA/ECBA/完全ACM）およびピリタンパク質のPVMコード、またはコロニー形成（HYL/PTSD/ORF1481）または可塑性（IS16）を強化する他のPVMは、臨床EFM（主にクレードA1）と強く関連していましたが、クレードA2/Bでも異なる程度で観察されました。PTSDは、アンピシリン耐性EFMの優れたマーカーでした。PTSD、IS16、ORF1481、SGRA、および完全なPILI遺伝子クラスターの病院バリアントは、EFM株の安全性を評価するためのマーカーとして提案されています。 結論：私たちの研究は、多様なEFM系統におけるPVMの分布について拡大し、EFSAのEFM安全基準のリストに以前は含まれていなかったPVMの感染由来株の濃縮を実証しています。関連するEFM感染マーカーの証拠は、異なる公衆衛生の文脈におけるEFM株のリスク評価に影響を与える可能性があります。
OBJECTIVES: The criteria for identification of Enterococcus faecium (Efm) with the ability to cause human infections are currently being debated by the European Food Safety Authority (EFSA). Strains that have an MIC of ampicillin of ≤ 2 mg/L and lack IS16/esp/hyl genes should be regarded as safe for use as feed additives in animal nutrition, despite the lack of knowledge about putative virulence marker (PVM) distribution in community Efm. We analysed the distribution of major PVM and ampicillin phenotypes in large Efm collections to investigate further the safety of strains from a public health perspective. METHODS: Thirty-three PVM were assessed by PCR/sequencing among clonally disparate Efm (n = 328; 1986-2015) from different origins. We analysed ampicillin susceptibility (Etest/broth microdilution) according to EUCAST guidelines, clonal relationship (MLST) and genomic location of PVM (S1-PFGE/hybridization). RESULTS: Infection-derived Efm were more enriched in PVM and the increase in ampicillin MIC was positively correlated with an enrichment in different PVM. PVM coding for surface (esp/sgrA/ecbA/complete acm) and pili proteins, or others enhancing colonization (hyl/ptsD/orf1481) or plasticity (IS16), were strongly associated with clinical Efm (mostly clade A1), but also observed in clades A2/B at different rates. ptsD was a good marker of ampicillin-resistant Efm. ptsD, IS16, orf1481, sgrA and hospital variants of complete pili gene clusters are proposed as markers to assess the safety of Efm strains. CONCLUSIONS: Our study expands on the distribution of PVM in diverse Efm lineages and demonstrates the enrichment in infection-derived strains of PVM not previously included in EFSA's list of Efm safety criteria. The evidence of relevant Efm infection markers can impact the risk assessment of Efm strains in different public health contexts.
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