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背景：2011年にアテネでは、薬物を注入する人（PWID）を注入する人の間でHIV-1感染の新しい診断が増加しました。 目的：私たちの目的は、PWID間のHIV流行拡散のパターンを調査し、主要なローカル伝送ネットワーク（LTNS）の伝送ダイナミクスを推定することでした。 方法：01/01/2011-31/10/10/10/10の間にギリシャでサンプリングされた2,274人のHIV感染被験者の配列を分析しました。サンプルの標本のうち、874シーケンスをHIV感染PWIDから分離しました。系統分析は、誕生死のシリアルスカイラインモデルを使用して実行されました。 結果：系統解析により、PWIDのシーケンスの大部分（n = 746、85.4％）が4つのLTNに落ちたことが明らかになりました：CRF14_BG（n = 456、58.3％）、CRF35_AD（n = 149、19.1％）、サブタイプB（n = 118、15.1％）およびA1（n = 59、7.5％）。PWIDに加えて、36の非PWIDからのシーケンスは、クロスグループトランスミッションに対応するLTNに属していることがわかりました。時間の経過に伴う有効生殖数（RE）の推定プロットに基づいて、サブタイプA1およびCRF35_AD LTNSは、2011年以前と2011年に急激に増加しました（RE = 3.0とRE = 4.6の最大値）。サブタイプBおよびCRF14_BG LTNSの場合、REは2012年末まで増加していました（RE = 3.2とRE = 3.0の最大値）。 結論：サブタイプBおよびCRF14_BGとは対照的に、アウトブレイクの初期段階でサブタイプA1およびCRF35_AD LTNS内のHIV送信が急激に増加しました。感染症の数の大幅な減少は、2013年の初めからすべての伝送ネットワークで推定されました。アリストテレスプログラムも含めて、2012年末にアテネ大都市圏で行われた予防措置は、この減少を説明するかもしれません。
背景：2011年にアテネでは、薬物を注入する人（PWID）を注入する人の間でHIV-1感染の新しい診断が増加しました。 目的：私たちの目的は、PWID間のHIV流行拡散のパターンを調査し、主要なローカル伝送ネットワーク（LTNS）の伝送ダイナミクスを推定することでした。 方法：01/01/2011-31/10/10/10/10の間にギリシャでサンプリングされた2,274人のHIV感染被験者の配列を分析しました。サンプルの標本のうち、874シーケンスをHIV感染PWIDから分離しました。系統分析は、誕生死のシリアルスカイラインモデルを使用して実行されました。 結果：系統解析により、PWIDのシーケンスの大部分（n = 746、85.4％）が4つのLTNに落ちたことが明らかになりました：CRF14_BG（n = 456、58.3％）、CRF35_AD（n = 149、19.1％）、サブタイプB（n = 118、15.1％）およびA1（n = 59、7.5％）。PWIDに加えて、36の非PWIDからのシーケンスは、クロスグループトランスミッションに対応するLTNに属していることがわかりました。時間の経過に伴う有効生殖数（RE）の推定プロットに基づいて、サブタイプA1およびCRF35_AD LTNSは、2011年以前と2011年に急激に増加しました（RE = 3.0とRE = 4.6の最大値）。サブタイプBおよびCRF14_BG LTNSの場合、REは2012年末まで増加していました（RE = 3.2とRE = 3.0の最大値）。 結論：サブタイプBおよびCRF14_BGとは対照的に、アウトブレイクの初期段階でサブタイプA1およびCRF35_AD LTNS内のHIV送信が急激に増加しました。感染症の数の大幅な減少は、2013年の初めからすべての伝送ネットワークで推定されました。アリストテレスプログラムも含めて、2012年末にアテネ大都市圏で行われた予防措置は、この減少を説明するかもしれません。
BACKGROUND: New diagnoses of HIV-1 infection among people who inject drugs (PWID) increased significantly during 2011 in Athens. OBJECTIVE: Our aim was to investigate the patterns of HIV epidemic spread among PWID and to estimate the transmission dynamics for the major local transmission networks (LTNs). METHODS: We analyzed sequences from 2,274 HIV-infected subjects sampled in Greece during 01/01/2011-31/10/2014. Of specimens in our sample, 874 sequences were isolated from HIV-infected PWID. Phylodynamic analysis was performed using birth-death serial skyline models. RESULTS: Phylogenetic analysis revealed that the majority of sequences from PWID (N=746, 85.4%) fell within four LTNs: CRF14_BG (N=456, 58.3%), CRF35_AD (N=149, 19.1%), subtype B (N=118, 15.1%) and A1 (N=59, 7.5%). In addition to PWID, we also found that sequences from 36 non-PWID belonged to the LTNs corresponding to cross-group transmissions. Based on the estimated plots of the effective reproductive number (Re) over time, subtype A1 and CRF35_AD LTNs showed a sharp increase before and during 2011 (maximum value of Re=3.0 and Re=4.6, respectively). For subtype B and CRF14_BG LTNs, the Re was increasing until the end of 2012 (maximum value of Re=3.2 and Re=3.0, respectively). CONCLUSION: HIV transmissions within subtype A1 and CRF35_AD LTNs increased sharply during the early stage of the outbreak, in contrast to subtype B and CRF14_BG. A significant reduction in the number of infections was estimated on all transmission networks from the beginning of 2013 onwards. Prevention measures that took place in the Athens metropolitan area at the end of 2012 including also the ARISTOTLE program may explain this decrease.
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