Pychimera：Python 27プロジェクトでUCSFキメラモジュールを使用する

動機：UCSFキメラは、計算化学および構造生物学コミュニティに著しく存在する強力な視覚化ツールです。Python 2.7環境の下にラップされたC ++コアの上に構築されているため、カスタムスクリプトまたはソフトウェアプロジェクトでUCSF Chimeraのリソースの武器を簡単にインポートすることが期待できます。それにもかかわらず、プラットフォームの分離のためにスクリプトがUCSFキメラ内で実行されない場合、これは容易に不可能です。元のキメラの後継者であるUCSF Chimeraxは、問題を部分的に解決しますが、この更新されたバージョンがすべてのUCSFキメラ機能を提供できるように、主要なアップグレードを受ける必要があります。 結果：Pychimeraは、これらの制限を克服し、IPythonやJupyterノートブックなどのツールを使用したインタラクティブなプログラミングを含むPython 2.7インタープリターからUCSF Chimera Codebaseへのアクセスを提供するために開発されました。 可用性と実装：PychimeraはLGPLライセンスがあり、https：//github.com/insilichem/pychimeraで入手可能です。 連絡先：jaime.rodriguezguerra@uab.catまたはjeandidier.marechal@uab.cat。 補足情報：補足データは、バイオインフォマティクスオンラインで入手できます。

MOTIVATION: UCSF Chimera is a powerful visualization tool remarkably present in the computational chemistry and structural biology communities. Built on a C++ core wrapped under a Python 2.7 environment, one could expect to easily import UCSF Chimera's arsenal of resources in custom scripts or software projects. Nonetheless, this is not readily possible if the script is not executed within UCSF Chimera due to the isolation of the platform. UCSF ChimeraX, successor to the original Chimera, partially solves the problem but yet major upgrades need to be undergone so that this updated version can offer all UCSF Chimera features. RESULTS: PyChimera has been developed to overcome these limitations and provide access to the UCSF Chimera codebase from any Python 2.7 interpreter, including interactive programming with tools like IPython and Jupyter Notebooks, making it easier to use with additional third-party software. AVAILABILITY AND IMPLEMENTATION: PyChimera is LGPL-licensed and available at https://github.com/insilichem/pychimera. CONTACT: jaime.rodriguezguerra@uab.cat or jeandidier.marechal@uab.cat. SUPPLEMENTARY INFORMATION: Supplementary data are available at Bioinformatics online.