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Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)20180101Vol.1745issue()

網膜色素上皮細胞株(ARPE-19)は、モザイク構造染色体異常を示しています

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文献タイプ:
  • Journal Article
  • Research Support, Non-U.S. Gov't
概要
Abstract

網膜色素上皮細胞株ARPE-19は1996年に設立され、今日では生物医学、特に眼科研究のために広く使用されています。ARPE-19細胞株の染色体を分析し、培養細胞が正常な核型と染色体再編成の両方を持つ不均一な混合物として存在することがわかりました。ARPE-19細胞では、単一の転座T(15; 19)と2つの転座T(5; 15)とT(15; 19)および誘導体染色体9を含む中期を伴う中期を観察しました。:-16;トリソミー:+11、+18)。正常な核型の細胞の老化により、異常な核型を持つものから正常な核型を持つクローンを分離しようとする複数の試みが失敗しました。ただし、転座t(15; 19)と2つの転座T(5; 15)とt(15; 19)でクローンを分離することができます。30の通路の2回目のサブクローニング後の継続的な細胞培養では、すべてのクローンが細胞遺伝学的完全性を維持しました。私たちは、別の実験室からのARPE-19細胞株の染色体プロファイルをさらに調査し、染色体6pおよび染色体の正常な核型と異常で観察された細胞を調査しました。11Q。両方のラボからのARPE-19細胞のDNAプロファイルは、他の細胞株との汚染を除いて、ATCCプロファイルと同一でした。ARPE-19細胞の染色体転座は研究室ごとに異なり、構造染色体異常のモザシズムを示すため、ARPE-19細胞を扱う研究者は染色体異常のストックをスクリーニングし、この細胞株での実験的操作中の誤解に注意を払う必要があります。この章では、網膜色素上皮細胞株ARPE-19の染色体転座の同定と特性評価に使用した、単一細胞クローン、核型分析、蛍光in situハイブリダイゼーション(FISH)のための実験方法について詳しく説明します。

網膜色素上皮細胞株ARPE-19は1996年に設立され、今日では生物医学、特に眼科研究のために広く使用されています。ARPE-19細胞株の染色体を分析し、培養細胞が正常な核型と染色体再編成の両方を持つ不均一な混合物として存在することがわかりました。ARPE-19細胞では、単一の転座T(15; 19)と2つの転座T(5; 15)とT(15; 19)および誘導体染色体9を含む中期を伴う中期を観察しました。:-16;トリソミー:+11、+18)。正常な核型の細胞の老化により、異常な核型を持つものから正常な核型を持つクローンを分離しようとする複数の試みが失敗しました。ただし、転座t(15; 19)と2つの転座T(5; 15)とt(15; 19)でクローンを分離することができます。30の通路の2回目のサブクローニング後の継続的な細胞培養では、すべてのクローンが細胞遺伝学的完全性を維持しました。私たちは、別の実験室からのARPE-19細胞株の染色体プロファイルをさらに調査し、染色体6pおよび染色体の正常な核型と異常で観察された細胞を調査しました。11Q。両方のラボからのARPE-19細胞のDNAプロファイルは、他の細胞株との汚染を除いて、ATCCプロファイルと同一でした。ARPE-19細胞の染色体転座は研究室ごとに異なり、構造染色体異常のモザシズムを示すため、ARPE-19細胞を扱う研究者は染色体異常のストックをスクリーニングし、この細胞株での実験的操作中の誤解に注意を払う必要があります。この章では、網膜色素上皮細胞株ARPE-19の染色体転座の同定と特性評価に使用した、単一細胞クローン、核型分析、蛍光in situハイブリダイゼーション(FISH)のための実験方法について詳しく説明します。

The retinal pigment epithelial cell line ARPE-19 was established in 1996 and remains widely used today for biomedical and in particular ophthalmology research. We have analyzed the chromosomes of the ARPE-19 cell line and found cultured cells exist as a heterogeneous mixture having both normal karyotypes and chromosomal rearrangements. In ARPE-19 cells, we observed metaphases with a single translocation t(15;19) and metaphases with two translocations t(5;15) and t(15;19) and a derivative chromosome 9. Aneuploidies have also been detected (monosomy: -16; trisomy: +11, +18). Multiple attempts to isolate clones with a normal karyotype from those with aberrant karyotypes failed due to senescence of cells of normal karyotypes. We could, however, isolate clones with the translocation t(15;19) and clones with two translocations t(5;15) and t(15;19). In continued cell culture after second subcloning for 30 passages, all clones maintained their cytogenetic integrity.We have further investigated the chromosomal profiles of the ARPE-19 cell line from another laboratory and observed cells with a normal karyotype as well as abnormalities in chromosomes 6p and 11q. The DNA profiles of the ARPE-19 cells from both labs were identical to the ATCC profiles, excluding contamination with other cell lines. Since chromosomal translocations in ARPE-19 cells differ from lab to lab and display a mosaicism for structural chromosomal aberrations, researchers dealing with ARPE-19 cells should screen their stocks for chromosomal aberrations and proceed with caution against misinterpretations during experimental manipulations with this cell line. This chapter describes in detail our laboratory methods for single cell cloning, karyotype analysis and fluorescence in situ hybridization (FISH), which we used for the identification and characterization of chromosomal translocations in the retinal pigment epithelial cell line ARPE-19.

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