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1型糖尿病における特定のHLAクラスII対立遺伝子の寄与は、したがって、抗原結合を指示する多型アミノ酸エピトープによって決定され、従来の対立遺伝子頻度分析とともに、エピトープ分析は疾患感受性に関する重要な洞察を提供できます。T1DM患者とコントロールのHLAクラスII遺伝子座の非常に不均一なキプロス集団を分析し、それらの対立遺伝子頻度を初めて報告しました。患者のコホート内で、DRB1*03：01-DQA1*05：01-DQB1*02：01およびDRB1*04：XX-DQA1*03：01-DQB1*03：03：02リスクハプロタイプがありますが、新規再生剤を特定しなかったサブグループを特定しました。DRB1*04：XX-DQA1*03：01-DQB1*02：01指定DR4-DQ2.3。エピトープ分析により、確立された感受性（DQB1 A57、DRB1 H13）および耐性（DQB1 D57）残基、および他の新規感受性残基DRB1 Q70、DQB1 L26および耐性残基DRB1 D70、R70、DQB1 Y47を特定しました。感受性エピトープの有病率は患者でより高く、連鎖不均衡の結果ではなかった。残基DRB1 Q70、DQB1 L26およびA57、およびDQA1の10アミノ酸エピトープは、識別リスク対立遺伝子で最も重要でした。これらのエピトープを含む拡張ハプロタイプは、患者コホートの92％によって運ばれました。感受性エピトープの共有は、患者のリスクハプロタイプの欠如を説明することもできます。最後に、多くの有意に関連するエピトープは、結合ポケットからさらに顕著な免疫機能が存在する可能性があることを示唆する非ポケット残留物でした。
1型糖尿病における特定のHLAクラスII対立遺伝子の寄与は、したがって、抗原結合を指示する多型アミノ酸エピトープによって決定され、従来の対立遺伝子頻度分析とともに、エピトープ分析は疾患感受性に関する重要な洞察を提供できます。T1DM患者とコントロールのHLAクラスII遺伝子座の非常に不均一なキプロス集団を分析し、それらの対立遺伝子頻度を初めて報告しました。患者のコホート内で、DRB1*03：01-DQA1*05：01-DQB1*02：01およびDRB1*04：XX-DQA1*03：01-DQB1*03：03：02リスクハプロタイプがありますが、新規再生剤を特定しなかったサブグループを特定しました。DRB1*04：XX-DQA1*03：01-DQB1*02：01指定DR4-DQ2.3。エピトープ分析により、確立された感受性（DQB1 A57、DRB1 H13）および耐性（DQB1 D57）残基、および他の新規感受性残基DRB1 Q70、DQB1 L26および耐性残基DRB1 D70、R70、DQB1 Y47を特定しました。感受性エピトープの有病率は患者でより高く、連鎖不均衡の結果ではなかった。残基DRB1 Q70、DQB1 L26およびA57、およびDQA1の10アミノ酸エピトープは、識別リスク対立遺伝子で最も重要でした。これらのエピトープを含む拡張ハプロタイプは、患者コホートの92％によって運ばれました。感受性エピトープの共有は、患者のリスクハプロタイプの欠如を説明することもできます。最後に、多くの有意に関連するエピトープは、結合ポケットからさらに顕著な免疫機能が存在する可能性があることを示唆する非ポケット残留物でした。
The contribution of specific HLA Class II alleles in type 1 diabetes is determined by polymorphic amino acid epitopes that direct antigen binding therefore, along with conventional allele frequency analysis, epitope analysis can provide important insights into disease susceptibility. We analyzed the highly heterogeneous Cypriot population for the HLA class II loci of T1DM patients and controls and we report for the first time their allele frequencies. Within our patient cohort we identified a subgroup that did not carry the DRB1*03:01-DQA1*05:01-DQB1*02:01 and DRB1*04:xx-DQA1*03:01-DQB1*03:02 risk haplotypes but a novel recombinant one, DRB1*04:XX-DQA1*03:01-DQB1*02:01 designated DR4-DQ2.3. Through epitope analysis we identified established susceptibility (DQB1 A57, DRB1 H13) and resistance (DQB1 D57) residues as well as other novel susceptibility residues DRB1 Q70, DQB1 L26 and resistance residues DRB1 D70, R70 and DQB1 Y47. Prevalence of susceptibility epitopes was higher in patients and was not exclusively a result of linkage disequilibrium. Residues DRB1 Q70, DQB1 L26 and A57 and a 10 amino acid epitope of DQA1 were the most significant in discriminating risk alleles. An extended haplotype containing these epitopes was carried by 92% of our patient cohort. Sharing of susceptibility epitopes could also explain the absence of risk haplotypes in patients. Finally, many significantly associated epitopes were non-pocket residues suggesting that critical immune functions may exist spanning further from the binding pockets.
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