乳がんのゲノム層別化とメタブリックコホートにおける中心的にレビューされた腫瘍病理との関連

2000年の乳房腫瘍のゲノムおよびトランスクリプトームプロファイルの統合は、乳がん国際コンソーシアムの分子分類法]コホートから、異なるゲノムドライバーによって特徴付けられる統合クラスター（intclust/s）と呼ばれる10のサブタイプを明らかにしました。中央組織病理学（n = 1643）レビューが行われ、これらの10の分子サブタイプと従来の臨床病理学的特徴の関係を調査しました。intclustサブタイプは、組織学的型、腫瘍グレード、受容体の状態、およびリンパ球浸潤と有意に関連していた（p <0.0001）。リンパ節状態とノッティンガム予後指数[NPI]カテゴリも、Intclustサブタイプと有意に関連していました。intclust 3は管状癌および小葉がんのために濃縮され、後者はこのクラスターのCDH1変異との関連を主に占めています。粘液性癌は、intclusts 5または10には存在しませんでしたが、残りのintclustのいずれとの関連を示さなかった。対照的に、髄質様がんは、intclust 10（15/26）と関連していました。ホルモン受容体陽性腫瘍は、すべてのintclustに散在していました。Intclust 5は、ホルモン受容体陽性（60/72）とホルモン受容体陰性腫瘍（67/77）の両方を含むHER2陽性（127/151）によって支配されていました。トリプルネガティブ腫瘍は、intclust 10（132/159）の大部分と、intclust 4（52/217）の約4分の1で構成されていました。乳がんの10個のintclustサブタイプは、従来の臨床病理学的変数との関連性の特徴的なパターンを示していますが、これらの変数のみによって適切に識別されることはできません。したがって、ゲノム層別化の添加は、現在の臨床評価の生物学的関連性を高め、ゲノム誘導治療戦略を促進する可能性があります。

The integration of genomic and transcriptomic profiles of 2000 breast tumours from the METABRIC [Molecular Taxonomy of Breast Cancer International Consortium] cohort revealed ten subtypes, termed integrative clusters (IntClust/s), characterised by distinct genomic drivers. Central histopathology (N = 1643) review was undertaken to explore the relationship between these ten molecular subtypes and traditional clinicopathological features. IntClust subtypes were significantly associated with histological type, tumour grade, receptor status, and lymphocytic infiltration (p < 0.0001). Lymph node status and Nottingham Prognostic Index [NPI] categories were also significantly associated with IntClust subtype. IntClust 3 was enriched for tubular and lobular carcinomas, the latter largely accounting for the association with CDH1 mutations in this cluster. Mucinous carcinomas were not present in IntClusts 5 or 10, but did not show an association with any of the remaining IntClusts. In contrast, medullary-like cancers were associated with IntClust 10 (15/26). Hormone receptor-positive tumours were scattered across all IntClusts. IntClust 5 was dominated by HER2 positivity (127/151), including both hormone receptor-positive (60/72) and hormone receptor-negative tumours (67/77). Triple-negative tumours comprised the majority of IntClust 10 (132/159) and around a quarter of IntClust 4 (52/217). Whilst the ten IntClust subtypes of breast cancer show characteristic patterns of association with traditional clinicopathological variables, no IntClust can be adequately identified by these variables alone. Hence, the addition of genomic stratification has the potential to enhance the biological relevance of the current clinical evaluation and facilitate genome-guided therapeutic strategies.