[HBV遺伝子型Dに感染した患者グループからのB型肝炎ウイルス（HBV）Pres1、Pres2およびS遺伝子領域の分析D]

B型肝炎ウイルスゲノムのPRSおよびS遺伝子領域の変異は、免疫脱出および診断脱出HBV変異体を引き起こす可能性があります。この研究の目的は、HBV感染患者群からのHBVのPRES1、PRES2、およびS遺伝子領域を配列分析により決定し、関連する文献に貢献することでした。HBV検査のために、EGE University Medical Microbiology Department Molecular Wirology Laboratoryに送信された56のアーカイブされた血漿サンプルからのHBV PCR産物のPresおよびS遺伝子の核酸配列分析は、連鎖終了反応によって決定されました。アミノ酸（AA）配列は、GenBankから得られた参照配列と比較されました。血漿サンプルは、典型的なHBV血清学的プロファイル（22のサンプル）のA-慢性HBV感染患者、肝移植後の非定型HBV血清学的プロファイル（26サンプル）、C-HBV再感染患者のA-慢性HBV感染患者の4つの患者に属していました。（5つのサンプル）、急性HBV感染後のD-血清変換相（3つのサンプル）。2つのワクチンエスケープ変異サンプルの1つは、診断脱出変異体でもありました。他の診断脱出変異体は、抗HBC陽性サンプルから分離されました。すべての配列は、遺伝子型Dとして決定されました。HBSAGサブタイプは次のように決定されました。2つのAYW1、6 AYW3、2つのミックス、46 AYW2。Pres 33rdとS 162ndアミノ酸の間で分析された304のコドンの中で。AAバリアントは105のコドン（34.5％）で決定されました。シーケンスは、genbankにアクセッション番号FJ001941-FJ001996で見つけることができます。少なくとも1つのAAバリエーションが56のサンプルのうち48（85.7％）で検出されました。アミノ酸変異体は次のとおりでした。PRES1：A33T、A39T、P41K、D44DEL、D50N、T51P、D54N、L65P/M、F67L、W77T、A81S、Q82E、I84T、L85I/M、Q86H/T、L88S96A、T97I/A、N98K、Q100K、S101T、S109T、P110S、N114D/E、PRES2：M1V、Q2R、S5H、F8S、H9Q、Q13L、D14N、R16K、R18K、G19S/D、F22L/S、S28TG30E、N33T、V39A、P41H/L、I42T/L、I45T、F46Y、S47L、R48K、I49T、D51V/G、P52L、A53V、L54R/G、N55K;S遺伝子：E2D、I4F、F8L、G10A、V14A、F20S、L22DEL、R24K、P29L、Q30K、N40S、F41DEL、G44E、T45L、T46P、V47A、L49R、Q54R、P56L、S64F、P75i、M75i、M75i、M75i、M75i、、I81T、F83C、L88P、L94S、Y100F、Q101H/R、M103L、L104F、L109I/M、I110L、G112S/R、S113N/P、S114A/DEL、T115I、T116N、T118A/K、P120A/T、T123A、「a」決定要因。T126I、Q129H/R、T131N、M133T、Y134N、S136Y、S143L/M/T、D144E、G145A/R。削除は、3つのpres/s遺伝子領域すべてでも見られました。AAバリエーションの最大数は、孤立した抗HBC陽性サンプル（24コドン）で検出され、肝臓移植群（8-13コドン）が続きました。PRISE2/SプロモーターCCAATボックスで点変異が検出されました。主要な親水領域（MHR）バリアントは、56のサンプルの41.1％で決定されました。最も多くのMHRバリアントは、非定型HBV血清学的プロファイルグループ（グループB; 61.5％）とHBV再感染を伴う肝臓移植グループ（すべてのCグループ）に属していました。診断脱出および免疫脱出変異体（抗HBS陽性）サンプルの中で、報告されたMHRおよび「A」決定因子変異が検出されました。結論として、研究集団にはHBV pres/sバリアントが含まれています。MHRおよび「A」決定因子変異率は、診断または免疫脱出変異体の間で高くなっています。HBSAGテストの変異検出性能を評価することが重要です。

Mutations in preS and S gene regions of hepatitis B virus genome may cause immune escape and diagnostic escape HBV mutants. The aim of this study was to determine preS1, preS2 and S gene regions of HBV from HBV infected patient groups by sequence analysis and contribute to the relevant literature. Nucleic acid sequence analysis of preS and S genes of HBV PCR products from 56 archived plasma samples sent to Ege University Faculty of Medicine Medical Microbiology Department Molecular Virology laboratory, for HBV tests were determined by chain termination reaction. Amino acid (aa) sequences were compared with the reference sequences obtained from GenBank. Plasma samples belonged to four groups of patients: A- Chronic HBV infected patients with typical HBV serological profiles (22 samples), B- HBV infected patients with atypical HBV serological profiles (26 samples), C- HBV re-infected patients after liver transplantation (5 samples), D- Seroconversion phase following acute HBV infection (3 samples). One of two vaccine escape mutant samples was also diagnostic escape mutant; the other diagnostic escape mutant was isolated from anti-HBc positive sample. All of the sequences were determined as genotype D. HBsAg subtypes were determined as; two ayw1, six ayw3, two mix, 46 ayw2. Among the 304 codons analysed between preS 33rd and S 162nd amino acids; aa variants were determinedin 105 codons (34.5%). Sequences can be found in GenBank with accession numbers FJ001941-FJ001996. At least one aa variation was detected in 48 of 56 samples (85.7%). The amino acid variants were as follows; PreS1: A33T, A39T, P41K, D44del, D50N, T51P, D54N, L65P/M, F67L, W77T, A81S, Q82E, I84T, L85I/M, Q86H/T, L88S, A90T/V, N91K/del, A95P, S96A, T97I/A, N98K, Q100K, S101T, S109T, P110S, N114D/E, PreS2: M1V, Q2R, S5H, F8S, H9Q, Q13L, D14N, R16K, R18K, G19S/D, F22L/S, S28T, G30E, N33T, V39A, P41H/L, I42T/L, I45T, F46Y, S47L, R48K, I49T, D51V/G, P52L, A53V, L54R/G, N55K; S gene: E2D, I4F, F8L, G10A, V14A, F20S, L22del, R24K, P29L, Q30K, N40S, F41del, G44E, T45L, T46P, V47A, L49R, Q54R, P56L, S64F, P70A, M75I, C76Y, R79H, I81T, F83C, L88P, L94S, Y100F, Q101H/R, M103L, L104F, L109I/M, I110L, G112S/R, S113N/P, S114A/del, T115I, T116N, T118A/K, P120A/T, T123A, in "a" determinant; T126I, Q129H/R, T131N, M133T, Y134N, S136Y, S143L/M/T, D144E, G145A/R. Deletions were also found in all three preS/S gene regions. The highest number of aa variations were detectedin the isolated anti-HBc positive sample (in 24 codons), followed by liver transplant group (8-13 codons). Point mutation was detected in the preS2/S promoter CCAAT box. Major hydrophilic region (MHR) variants were determined in 41.1% of 56 samples. The highest number of MHR variants belonged to atypical HBV serological profile group (group B; 61.5%) and liver transplantation group with HBV re-infection (all C group). Among the diagnostic escape and immune escape mutant (anti-HBs positive) samples, reported MHR and "a" determinant mutations were detected. In conclusion, the study population carries HBV preS/S variants; MHR and "a" determinant variant rates are high among diagnostic or immune escape mutants. It is important to evaluate the mutant detection performance of HBsAg tests.