Chikungunyaウイルスの暗いプロテオームを解読します

Chikungunya Virus（Chikv）は蚊媒介アルファウイルスです。CHIKV感染の発生は、生物圏の多くの熱帯および亜熱帯領域で見られています。現在の報告では、2005年から2006年にかけて発生した後、エンベロープタンパク質の結果的な変異の変化のためにAldes Albopictusで伝播するこのウイルスのフィットネスが増加したことが証明されています。私たちの研究では、CHIKVプロテオームの本質的に無秩序なタンパク質（IDP）およびIDP領域（IDPR）の有病率を評価しました。IDPS/IDPRSは、細胞環境内のユニークな3次元構造のないポリペプチドセグメントまたはタンパク質全体として定義された「ダークプロテオーム」のメンバーとして知られていますが、細胞周期調節、シグナル伝達経路の制御、ウイルスタンパク質の維持などの重要な生物学的機能を備えています。しかし、この重要なウイルスの病原性メカニズムにおけるChikvプロテオームの本質的に乱れた側面とIDPS/IDPRの役割はまだ評価されていません。CHIKVの内因性障害状態の分析に関する既存の報告はありません。この目標を達成するために、複製と成熟に関与するCHIKVタンパク質のIDPS/IDPRSの存在量と機能を分析しました。これらのIDPS/IDPRSは、障害ベースの薬物設計の新しいターゲットとして機能する可能性があります。

Chikungunya virus (CHIKV) is a mosquito-borne alphavirus. The outbreak of CHIKV infection has been seen in many tropical and subtropical regions of the biosphere. Current reports evidenced that after outbreaks in 2005-06, the fitness of this virus propagating in Aedes albopictus enhanced due to the epistatic mutational changes in its envelope protein. In our study, we evaluated the prevalence of intrinsically disordered proteins (IDPs) and IDP regions (IDPRs) in CHIKV proteome. IDPs/IDPRs are known as members of a 'Dark Proteome' that defined as a set of polypeptide segments or whole protein without unique three-dimensional structure within the cellular milieu but with significant biological functions, such as cell cycle regulation, control of signaling pathways, and maintenance of viral proteomes. However, the intrinsically disordered aspects of CHIKV proteome and roles of IDPs/IDPRs in the pathogenic mechanism of this important virus have not been evaluated as of yet. There are no existing reports on the analysis of intrinsic disorder status of CHIKV. To fulfil this goal, we have analyzed the abundance and functionality of IDPs/IDPRs in CHIKV proteins, involved in the replication and maturation. It is likely that these IDPs/IDPRs can serve as novel targets for disorder based drug design.