18S RDNA V7領域の蒸気をとるパイロシーケンシングプロファイルを採用する珪藻コロニーの一貫性分析の潜在的な法医学的適用分析

珪藻検査は、法医学の実践におけるdr死の診断に常に使用されてきました。ただし、珪藻甲殻の顕微鏡的特徴の従来の調査は時間がかかり、分類学的専門知識が必要です。この研究では、珪藻DNAバーコードとして18SリボソームDNA（18S RDNA）のV7領域（18S RDNA）の声気（PSQ）を使用して、dr死の疑いのある部位を推測する潜在的なDNAベースの方法を示します。まばらな表現ベースのAdviser-M-Pyroアルゴリズムを採用することにより、珪藻DNA混合物の元のPSQ信号を解読して、複合珪藻の対応する分類群を決定しました。さらに、多次元スケーリングを介して水サンプルに含まれる珪藻混合物のPSQ信号プロファイルを分析することにより、水サンプルを収集部位と相関させる可能性を評価しました。結果は、珪藻土PSQプロファイル分析が、環境バイオサンプルの地理的起源を推定するための費用対効果の高い方法として使用できることを示唆しています。

Diatom examination has always been used for the diagnosis of drowning in forensic practice. However, traditional examination of the microscopic features of diatom frustules is time-consuming and requires taxonomic expertise. In this study, we demonstrate a potential DNA-based method of inferring suspected drowning site using pyrosequencing (PSQ) of the V7 region of 18S ribosome DNA (18S rDNA) as a diatom DNA barcode. By employing a sparse representation-based AdvISER-M-PYRO algorithm, the original PSQ signals of diatom DNA mixtures were deciphered to determine the corresponding taxa of the composite diatoms. Additionally, we evaluated the possibility of correlating water samples to collection sites by analyzing the PSQ signal profiles of diatom mixtures contained in the water samples via multidimensional scaling. The results suggest that diatomaceous PSQ profile analysis could be used as a cost-effective method to deduce the geographical origin of an environmental bio-sample.