構造生物学の原子変位パラメーター

構造的不均一性に依存する原子変位パラメーター（ADP、Bファクターとも呼ばれる）は、タンパク質構造とダイナミクスに関する幅広い情報を提供し、タンパク質立体構造障害の予測からタンパク質熱統合まで、およびタンパク質折り畳み速度からのいくつかの用途を見つけます。タンパク質結合部位の予測予測。重要な側面は、ADPが結晶学的解像度から改良プロトコルまで、いくつかの要因によって異なる影響を受けるため、2つ以上のタンパク質結晶構造間の比較が行われる場合のADPの標準化です。ADP分析の潜在的な制限は、ADPが物理化学的意味をほとんど持たない非常に大きな価値に膨らませるために現代的な傾向です。

Atomic displacement parameters (ADPs, also known as B-factors), which depend on structural heterogeneity, provide a wide spectrum of information on protein structure and dynamics and find several applications, from protein conformational disorder prediction to protein thermostabilization, and from protein folding kinetics prediction to protein binding sites prediction. A crucial aspect is the standardization of the ADPs when comparisons between two or more protein crystal structures are made, since ADPs are differently affected by several factors, from crystallographic resolution to refinement protocols. A potential limitation to ADP analysis is the modern tendency to let ADPs to inflate up to extremely large values that have little physico-chemical meaning.