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目的:青島州天津地域の人間と羊からのエキノコッカスgranulosusメタスセースストードの遺伝子型とヌクレオチド多型を理解する。 方法:特定のプライマーは、GenBankがアクセスしたE. granulosusミトコンドリアゲノム配列のCOX1およびNAD1遺伝子に従って設計されました。プライマーを使用して、PCRによって青島の天津領域のE. granulosusに感染した16の羊と2人のヒトからの嚢胞サンプルを検出し、PCR増幅産物を配列決定しました。 結果:18個の分離されたサンプルはすべて、E。granulosusG1遺伝子型に属していました。すべての分離株の中で、16のヌクレオチド変異部位を持つCOX1遺伝子に9つのハプロタイプが存在し、0.31%の最高変動率で0〜5のヌクレオチドの違いがありましたが、15のヌクレオチド変異部位で7つのハプロタイプが発生し、NAD1の8つのヌクレオチド差が1から8ヌクレオチド差がありました。 結論:E. granulosusの流行遺伝子型は、Qinghai州の天津地域のヒトと羊のG1であり、COX1遺伝子のヌクレオチド多型はNAD1遺伝子のそれよりも豊富であり、COX1遺伝子のヌクレオチド多型の解像度はE.
目的:青島州天津地域の人間と羊からのエキノコッカスgranulosusメタスセースストードの遺伝子型とヌクレオチド多型を理解する。 方法:特定のプライマーは、GenBankがアクセスしたE. granulosusミトコンドリアゲノム配列のCOX1およびNAD1遺伝子に従って設計されました。プライマーを使用して、PCRによって青島の天津領域のE. granulosusに感染した16の羊と2人のヒトからの嚢胞サンプルを検出し、PCR増幅産物を配列決定しました。 結果:18個の分離されたサンプルはすべて、E。granulosusG1遺伝子型に属していました。すべての分離株の中で、16のヌクレオチド変異部位を持つCOX1遺伝子に9つのハプロタイプが存在し、0.31%の最高変動率で0〜5のヌクレオチドの違いがありましたが、15のヌクレオチド変異部位で7つのハプロタイプが発生し、NAD1の8つのヌクレオチド差が1から8ヌクレオチド差がありました。 結論:E. granulosusの流行遺伝子型は、Qinghai州の天津地域のヒトと羊のG1であり、COX1遺伝子のヌクレオチド多型はNAD1遺伝子のそれよりも豊富であり、COX1遺伝子のヌクレオチド多型の解像度はE.
OBJECTIVE: To understand the genotypes and nucleotide polymorphisms of Echinococcus granulosus metacestode from humans and sheep in Tianjun region, Qinghai Province. METHODS: The specific primers were designed according to the cox1 and nad1 genes of E. granulosus mitochondrial genome sequences accessed by GenBank. The primers were used to detect the cyst samples from 16 sheep and 2 humans infected with E. granulosus in Tianjun region of Qinghai Province by PCR, then the PCR amplification products were sequenced, the genotypes and nucleotide polymorphisms of the cox1 and nad1 genes were analyzed. RESULTS: The 18 isolated samples all belonged to E. granulosus G1 genotype. Among all the isolates, 9 haplotypes existed in the cox1 gene with 16 nucleotide mutation sites, and there were 0 to 5 nucleotide differences with the highest variation rate of 0.31%, whereas 7 haplotypes occurred with 15 nucleotide mutation sites, and there were 1 to 8 nucleotide differences with the highest variation rate of 0.89% for the nad1 gene. CONCLUSIONS: The epidemic genotype of E. granulosus is G1 in humans and sheep in Tianjun region of Qinghai Province, and the nucleotide polymorphisms of the cox1 gene were more abundant than those of the nad1 gene, and the resolution of the nucleotide polymorphisms of cox1 gene is higher than that of the nad1 gene used in E. granulosus isolates.
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