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メキシコのピマインディアンの糖尿病と肥満の有病率は低く、米国のピマインディアンの有病率は高いです。ライフスタイルは違いの多くを占めている可能性がありますが、遺伝的要因の役割は十分に調査されていません。これを調べるために、342メキシコのピマで、2型糖尿病およびゲノムワイド関連研究（GWAS）および96のランダムマーカーからの確立された2型糖尿病および肥満変異体を含む359の単一ヌクレオチド多型を遺伝子型にしました。肥満バリアントのマルチマルカーリスクスコアは、ボディマス指数（BMI; SDあたり0.81 kg/m2、p = 0.0066）に関連していました。スコアの平均値は、メキシコのピマの方が米国のピマよりも低かった（p = 4.3×10-11）、確立された遺伝子座での対立遺伝子頻度の違いは、BMIの人口差の約7％を占める可能性があります。ただし、リスクスコアの違いは、遺伝的距離を考慮して進化の中立性と一致していました。最近の自然選択の下で潜在的に遺伝子座を特定するために、283のバリアントでの対立遺伝子頻度を米国とメキシコのピマとの間で比較し、遺伝的距離を占めました。HLAマーカーで最大の違いが見られました（例：RS9271720、差= 0.75、P = 8.7×10-9）。HLAの遺伝的距離は、ランダムマーカーよりも大きかった（P = 1.6×10-46）。937 US PIMAのGWASデータの分析では、HLAでの降下と同一の対立遺伝子の共有が、そのゲノムの期待を上回ることも示しています（P = 7.0×10-10）。これらの結果は、HLAで広く認識されているバランス選択に加えて、最近の方向選択も発生し、密接に関連する集団間の顕著な対立遺伝子の分化をもたらす可能性があることを示唆しています。
メキシコのピマインディアンの糖尿病と肥満の有病率は低く、米国のピマインディアンの有病率は高いです。ライフスタイルは違いの多くを占めている可能性がありますが、遺伝的要因の役割は十分に調査されていません。これを調べるために、342メキシコのピマで、2型糖尿病およびゲノムワイド関連研究（GWAS）および96のランダムマーカーからの確立された2型糖尿病および肥満変異体を含む359の単一ヌクレオチド多型を遺伝子型にしました。肥満バリアントのマルチマルカーリスクスコアは、ボディマス指数（BMI; SDあたり0.81 kg/m2、p = 0.0066）に関連していました。スコアの平均値は、メキシコのピマの方が米国のピマよりも低かった（p = 4.3×10-11）、確立された遺伝子座での対立遺伝子頻度の違いは、BMIの人口差の約7％を占める可能性があります。ただし、リスクスコアの違いは、遺伝的距離を考慮して進化の中立性と一致していました。最近の自然選択の下で潜在的に遺伝子座を特定するために、283のバリアントでの対立遺伝子頻度を米国とメキシコのピマとの間で比較し、遺伝的距離を占めました。HLAマーカーで最大の違いが見られました（例：RS9271720、差= 0.75、P = 8.7×10-9）。HLAの遺伝的距離は、ランダムマーカーよりも大きかった（P = 1.6×10-46）。937 US PIMAのGWASデータの分析では、HLAでの降下と同一の対立遺伝子の共有が、そのゲノムの期待を上回ることも示しています（P = 7.0×10-10）。これらの結果は、HLAで広く認識されているバランス選択に加えて、最近の方向選択も発生し、密接に関連する集団間の顕著な対立遺伝子の分化をもたらす可能性があることを示唆しています。
Prevalence of diabetes and obesity in Mexican Pima Indians is low, while prevalence in US Pima Indians is high. Although lifestyle likely accounts for much of the difference, the role of genetic factors is not well explored. To examine this, we genotyped 359 single nucleotide polymorphisms, including established type 2 diabetes and obesity variants from genome-wide association studies (GWAS) and 96 random markers, in 342 Mexican Pimas. A multimarker risk score of obesity variants was associated with body mass index (BMI; β = 0.81 kg/m2 per SD, P = 0.0066). The mean value of the score was lower in Mexican Pimas than in US Pimas (P = 4.3 × 10-11 ), and differences in allele frequencies at established loci could account for approximately 7% of the population difference in BMI; however, the difference in risk scores was consistent with evolutionary neutrality given genetic distance. To identify loci potentially under recent natural selection, allele frequencies at 283 variants were compared between US and Mexican Pimas, accounting for genetic distance. The largest differences were seen at HLA markers (e.g., rs9271720, difference = 0.75, P = 8.7 × 10-9 ); genetic distances at HLA were greater than at random markers (P = 1.6 × 10-46 ). Analyses of GWAS data in 937 US Pimas also showed sharing of alleles identical by descent at HLA that exceeds its genomic expectation (P = 7.0 × 10-10 ). These results suggest that, in addition to the widely recognized balancing selection at HLA, recent directional selection may also occur, resulting in marked allelic differentiation between closely related populations.
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