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繁殖性の多産品種（Ovis aries）は、生殖性のパフォーマンスにより重要な遺伝的資源であり、出生あたりの複数の子羊とシーズン外の繁殖が特徴です。しかし、特に進化のゲノミクスの観点から、重要な生殖特性の根底にある遺伝的メカニズムの包括的な理解の欠如は、ヒツジの繁殖の効率的な進歩を妨げています。ここでは、RNAシーケンスを実行することで初めて、ヨーロッパのムーフロン（卵子ムサモン）に卵巣および子宮内膜組織のde novoトランスクリプトームアセンブリを構築し、野生種のmRNA-miRNA統合発現プロファイリング分析と非常に多産国内の国内で行いました。羊の品種、フィンシープ。私たちは、卵母細胞と卵胞の発達と肥料に機能的に関与し、かなり（pを調整されている）野生と家庭の羊の間で、差次的に発現したmRNA（例：EREG、INHBA、SPP1、AMH、TDRD5、およびZP2）を持ついくつかの新規遺伝子を特定しました（例：EREG、INHBA、SPP1、AMH、TDRD5、およびZP2）。-Value <0.05）受精、卵形成、卵胞の発達、精子卵認識の調節を含む、さまざまな生殖プロセスの遺伝子オントロジー（GO）の用語で濃縮されています。さらに、特定の調節ネットワークを介した女性の生殖サイクルの調節に不可欠な58の差次的に発現したmiRNAと210の関連する標的遺伝子を特徴づけました[例えば、（miR-136、miR-374a、miR-9-5p） - （eerg、inhbaba）]。さらに、我々の統合されたmRNAおよびmiRNA発現プロファイリング分析は、卵子種の生殖特性に関連する新規直接的および間接的なmiRNA/mRNA因果調節関係を解明しました。この研究は、卵子種の生殖特性と卵巣ゲノミクスの貴重な資源の根底にあるゲノム進化に関する詳細な洞察を提供します。
繁殖性の多産品種（Ovis aries）は、生殖性のパフォーマンスにより重要な遺伝的資源であり、出生あたりの複数の子羊とシーズン外の繁殖が特徴です。しかし、特に進化のゲノミクスの観点から、重要な生殖特性の根底にある遺伝的メカニズムの包括的な理解の欠如は、ヒツジの繁殖の効率的な進歩を妨げています。ここでは、RNAシーケンスを実行することで初めて、ヨーロッパのムーフロン（卵子ムサモン）に卵巣および子宮内膜組織のde novoトランスクリプトームアセンブリを構築し、野生種のmRNA-miRNA統合発現プロファイリング分析と非常に多産国内の国内で行いました。羊の品種、フィンシープ。私たちは、卵母細胞と卵胞の発達と肥料に機能的に関与し、かなり（pを調整されている）野生と家庭の羊の間で、差次的に発現したmRNA（例：EREG、INHBA、SPP1、AMH、TDRD5、およびZP2）を持ついくつかの新規遺伝子を特定しました（例：EREG、INHBA、SPP1、AMH、TDRD5、およびZP2）。-Value <0.05）受精、卵形成、卵胞の発達、精子卵認識の調節を含む、さまざまな生殖プロセスの遺伝子オントロジー（GO）の用語で濃縮されています。さらに、特定の調節ネットワークを介した女性の生殖サイクルの調節に不可欠な58の差次的に発現したmiRNAと210の関連する標的遺伝子を特徴づけました[例えば、（miR-136、miR-374a、miR-9-5p） - （eerg、inhbaba）]。さらに、我々の統合されたmRNAおよびmiRNA発現プロファイリング分析は、卵子種の生殖特性に関連する新規直接的および間接的なmiRNA/mRNA因果調節関係を解明しました。この研究は、卵子種の生殖特性と卵巣ゲノミクスの貴重な資源の根底にあるゲノム進化に関する詳細な洞察を提供します。
Prolific breeds of domestic sheep (Ovis aries) are important genetic resources due to their reproductive performance, which is characterized by multiple lambs per birth and out-of-season breeding. However, the lack of a comprehensive understanding of the genetic mechanisms underlying the important reproductive traits, particularly from the evolutionary genomics perspective, has impeded the efficient advancement of sheep breeding. Here, for the first time, by performing RNA-sequencing we built a de novo transcriptome assembly of ovarian and endometrial tissues in European mouflon (Ovis musimon) and performed an mRNA-miRNA integrated expression profiling analysis of the wild species and a highly prolific domestic sheep breed, the Finnsheep. We identified several novel genes with differentially expressed mRNAs (e.g., EREG, INHBA, SPP1, AMH, TDRD5, and ZP2) between the wild and domestic sheep, which are functionally involved in oocyte and follicle development and fertilization, and are significantly (adjusted P-value < 0.05) enriched in the Gene Ontology (GO) terms of various reproductive process, including the regulation of fertilization, oogenesis, ovarian follicle development, and sperm-egg recognition. Additionally, we characterized 58 differentially expressed miRNAs and 210 associated target genes that are essential for the regulation of female reproduction cycles through specific regulatory networks [e.g., (miR-136, miR-374a, miR-9-5p)-(EREG, INHBA)]. Furthermore, our integrated mRNA and miRNA expression profiling analysis elucidated novel direct and indirect miRNA/mRNA causal regulatory relationships related to the reproductive traits of the Ovis species. This study provides in-depth insights into the genomic evolution underlying the reproductive traits of the Ovis species and valuable resources for ovine genomics.
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