SEVENS：ゲノムから得られた包括的なGPCR遺伝子のデータベース：-pdate 68真核生物

Sevensデータベースの発達を報告します。これには、さまざまな真核生物ゲノムから高い自信レベル（A、B、C、およびD）で同定されたGタンパク質結合受容体（GPCR）遺伝子に関する情報が含まれています。予測因子。Sevensは、染色体マッピング位置、系統樹、既知の遺伝子との配列類似性、モチーフ/ドメインおよび膜貫通ヘリックスによって記述されたタンパク質機能など、GPCR遺伝子に関する詳細情報を編集します。それらはユーザーフレンドリーなインターフェイスで表示されます。ゲノムからの包括的な遺伝子所見のため、Sevensには以前のデータベースのデータセットよりも大きなデータセットが含まれており、すべてのGPCR遺伝子のゲノムスケールの概要のパフォーマンスを可能にします。68の真核生物の完全なゲノムを調査し、各ゲノムに6〜3,470 GPCR遺伝子があることがわかりました（データレベルAデータ）。これらの遺伝子内では、生物学的アミン、ペプチド、脂質を含むさまざまな分子の受容体の数が哺乳類、鳥、魚に保存されていましたが、臭気剤受容体とフェロモン受容体の数は哺乳類では非常に多様でした。Sevensは、http：//sevens.cbrc.jpまたはhttp://sevens.chem.aoyama.ac.jpで無料で入手できます。

We report the development of the SEVENS database, which contains information on G-protein coupled receptor (GPCR) genes that are identified with high confidence levels (A, B, C, and D) from various eukaryotic genomes, by using a pipeline comprising bioinformatics softwares, including a gene finder, a sequence alignment tool, a motif and domain assignment tool, and a transmembrane helix predictor. SEVENS compiles detailed information on GPCR genes, such as chromosomal mapping position, phylogenetic tree, sequence similarity to known genes, and protein function described by motif/domain and transmembrane helices. They are presented in a user-friendly interface. Because of the comprehensive gene findings from genomes, SEVENS contains a larger data set than that of previous databases and enables the performance of a genome-scale overview of all the GPCR genes. We surveyed the complete genomes of 68 eukaryotes, and found that there were between 6 and 3,470 GPCR genes for each genome (Level A data). Within these genes, the number of receptors for various molecules, including biological amines, peptides, and lipids, were conserved in mammals, birds, and fishes, whereas the numbers of odorant receptors and pheromone receptors were highly diverse in mammals. SEVENS is freely available at http://sevens.cbrc.jp or http://sevens.chem.aoyama.ac.jp.