耐性プラスミドR1のTRAM遺伝子：大腸菌F因子の対応する配列との比較

耐性プラスミドR1の7.7 kb ECORIフラグメントには、TRAMタンパク質の遺伝子が含まれています。シーケンスは、2つのプロモーターシーケンスが上流に先行するオープンリーディングフレーム（ORF）の存在によって識別されました。これらのプロモーターは両方とも活性であることがわかりましたが、予想される長さのmRNAの相対的な存在量によって判断されたように、より遠いものが優勢であることがわかりました。対応する領域のDNAがテンプレートとして供給された場合、TRAMタンパク質はin vitro DNA依存性タンパク質合成システムで合成できます。R1とF因子のTRAM遺伝子の比較は、特に5 '末端近くに多くの変異が特定のアミノ酸（AA）の変化をもたらすものの、高度な類似性を示しました。3 'シーケンスの3分の2は、主にサイレント変異が異なります。したがって、タンパク質の対応するカルボキシ末端部分のAA配列は高度に保存されています。mRNAの5 'および3'翻訳されていない領域は、ほとんど相同性を示しません。プロモーター領域の1つであるリボソーム結合配列、および転写終端部位は、同等の位置にありますが、詳細は異なります。

The 7.7-kb EcoRI fragment of the resistance plasmid R1 contains the gene for the TraM protein. The sequence was identified by the presence of an open reading frame (ORF) which is preceded upstream by two promoter sequences. Both these promoters were found to be active, although the more distant one predominates, as was judged by the relative abundance of mRNA of the expected length. The TraM protein could be synthesized in an in vitro DNA-dependent protein synthesis system if the DNA of the corresponding region was supplied as template. Comparison of the traM genes of R1 and the F factor showed a high degree of similarity, although a number of mutations, especially near the 5' terminus, introduce specific amino acid (aa) changes. Two-thirds of the 3' sequences differ mainly in silent mutations; hence the aa sequence of the corresponding carboxy-terminal portion of the protein is highly conserved. The 5' and 3' untranslated regions of the mRNAs show little homology. One of the promoter regions, the ribosome-binding sequences, and the transcription termination sites are located at comparable positions but differ in details.