[多糖類の含有量が多い真菌からのCTAB-PEG DNA抽出]

多糖類は、抽出されたDNAの濃度と純度に影響します。ここでは、多糖類が豊富なサンプルからのDNA抽出のための迅速かつ効率的なプロトコルを提示します。この手法は、Chizophyllum communeの培養を使用して開発されており、既知のセチルトリメチル臭化アンモニウム（CTAB）プロトコルの修飾を伴います。多糖類を除去するために、DNA沈殿中にポリエチレングリコール（PEG）8000を添加しました。CTAB-PEG法で得られたゲノムDNAは、平均フラグメントサイズが30 kbを超える平均断片サイズ、濃度が100 ng/μLを超え、収率が30μg/gを超える高度で高い完全性を示しました。提示された技術は、多糖類が高い菌類、細菌、古細菌、さらには軟体動物からのDNA抽出に適しています。

Polysaccharides influence concentration and purity of extracted DNA. Here we present rapid and efficient protocol for DNA extraction from samples rich in polysaccharides. The technique has been developed using cultures of Schizophyllum commune and involves a modification of known Cetyltrimethyl Ammonium Bromide (CTAB) protocol. To remove polysaccharides, Polyethylene Glycol (PEG) 8000 was added during DNA precipitation. Genomic DNA obtained with the CTAB-PEG method had high integrity, with average fragment size >30 kb, the concentration higher than 100 ng/μL, and the yield more than 30 μg/g. Presented technique is suitable for DNA extraction from fungi, bacteria, archaea or even mollusks with high polysaccharide content.