MHC関連ペプチドプロテオミクスは、免疫原性が低い治療抗体の発生のための免疫原性配列の高感度検出を可能にします

免疫原性は、治療的抗体の有効性と安全性に影響を与えることができる重要な要因です。MHC関連ペプチドプロテオミクス（MAPPS）と呼ばれる最近開発された方法は、液体クロマトグラフィー/質量分析を使用して、抗原前細胞、したがって、主要組織互換複雑なクラスII（MHC II）によって提示される治療タンパク質に由来するペプチド配列を特定します。免疫原性を誘発する可能性があります。この研究では、スループットが高く、免疫沈降プロセスの親水性ポリマーでコーティングされた磁気ナノ粒子ビーズを使用して治療抗体に由来するMHC IIプレゼンテーションペプチドを効率的に識別できるマップス技術（ABマップと呼ばれる）を開発しました。磁気ビーズは、マップに一般的に使用されるセファロースビーズよりも短い測定時間でインフリキシマブとアダリムマブに由来するより多くのペプチドと配列領域を識別できます。インフリキシマブのABマップによって特定されたいくつかの配列領域は、他の方法によって報告された免疫原性配列に対応しており、免疫原性に関与する重要な配列を特定する方法の高い可能性を示唆しています。さらに、我々の研究では、ABマップ法は、異なるレベルのT細胞増殖活性を持つ類似の抗体配列間の単一のアミノ酸残基の違いを認識し、MHC IIへの高い結合親和性を持つ潜在的に免疫原性ペプチドを特定できることを示唆しています。結論として、AB-Mappsは治療抗体の免疫原性配列を特定するのに役立ち、創薬段階での免疫原性が低い治療抗体の設計に寄与します。

Immunogenicity is a key factor capable of influencing the efficacy and safety of therapeutic antibodies. A recently developed method called MHC-associated peptide proteomics (MAPPs) uses liquid chromatography/mass spectrometry to identify the peptide sequences derived from a therapeutic protein that are presented by major histocompatibility complex class II (MHC II) on antigen-presenting cells, and therefore may induce immunogenicity. In this study, we developed a MAPPs technique (called Ab-MAPPs) that has high throughput and can efficiently identify the MHC II-presented peptides derived from therapeutic antibodies using magnetic nanoparticle beads coated with a hydrophilic polymer in the immunoprecipitation process. The magnetic beads could identify more peptides and sequence regions originating from infliximab and adalimumab in a shorter measurement time than Sepharose beads, which are commonly used for MAPPs. Several sequence regions identified by Ab-MAPPs from infliximab corresponded to immunogenic sequences reported by other methods, which suggests the method's high potential for identifying significant sequences involved in immunogenicity. Furthermore, our study suggests that the Ab-MAPPs method can recognize the difference of a single amino acid residue between similar antibody sequences with different levels of T-cell proliferation activity and can identify potentially immunogenic peptides with high binding affinity to MHC II. In conclusion, Ab-MAPPs is useful for identifying the immunogenic sequences of therapeutic antibodies and will contribute to the design of therapeutic antibodies with low immunogenicity during the drug discovery stage.