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背景：リネゾリド（オキサゾリジノン抗生物質）に対する低レベルの耐性を持つ腸球菌株株が一般的になりました。大規模な研究では、リネゾリド耐性E. faecalis（LRE）株の基礎となるメカニズムを調べていません。中国のチョンギンでこれらのメカニズムと分子特性を調査しました。 方法：2014年8月から2017年6月までに収集された合計1,120の非重複E. faecalis株が、薬物感受性検査を受けました。PCR増幅と配列決定により、23S RRNAおよびリボソームタンパク質L3およびL4のOPTRA、CFR、および変異についてLRE株をスクリーニングしました。疫学的分析には、多焦点配列タイピング（MLST）およびパルスフィールドゲル電気泳動（PFGE）を使用しました。 結果：43の低レベルのLRE株（最小阻害濃度：8-16 mg/L）がOPTRAを抱えています。CFRおよび23S RRNA変異は検出されませんでした。リボソームタンパク質L3およびL4-one欠失（Q103DEL）および4つの置換（S113L、T35A、I98V、およびN79D）の新規変異が特定されました。OPTRAタンパク質の位置E60K、G197D、およびT285Pの位置での新規アミノ酸置換が観察されました。MLSTは20種類のLRE株を明らかにしました。最も一般的なタイプはST16（32.6％）でした。PFGEは、一意のバンディングパターンを備えたST16の14株を示しました。8つの新規シーケンスタイプ（ST823からST830）と1つの対立遺伝子（GKI95）が中国で初めて特定されました。 結論：OPTRAは、リネゾリド耐性に重要な役割を果たし、耐性スクリーニングのマーカーとして機能する可能性があります。L3とL4変異は同じ株で同時に発生しなかったため、リネゾリッド耐性において無視できる役割を果たします。疫学的調査は、LRE症例が散発的であることを示唆しました。
背景：リネゾリド（オキサゾリジノン抗生物質）に対する低レベルの耐性を持つ腸球菌株株が一般的になりました。大規模な研究では、リネゾリド耐性E. faecalis（LRE）株の基礎となるメカニズムを調べていません。中国のチョンギンでこれらのメカニズムと分子特性を調査しました。 方法：2014年8月から2017年6月までに収集された合計1,120の非重複E. faecalis株が、薬物感受性検査を受けました。PCR増幅と配列決定により、23S RRNAおよびリボソームタンパク質L3およびL4のOPTRA、CFR、および変異についてLRE株をスクリーニングしました。疫学的分析には、多焦点配列タイピング（MLST）およびパルスフィールドゲル電気泳動（PFGE）を使用しました。 結果：43の低レベルのLRE株（最小阻害濃度：8-16 mg/L）がOPTRAを抱えています。CFRおよび23S RRNA変異は検出されませんでした。リボソームタンパク質L3およびL4-one欠失（Q103DEL）および4つの置換（S113L、T35A、I98V、およびN79D）の新規変異が特定されました。OPTRAタンパク質の位置E60K、G197D、およびT285Pの位置での新規アミノ酸置換が観察されました。MLSTは20種類のLRE株を明らかにしました。最も一般的なタイプはST16（32.6％）でした。PFGEは、一意のバンディングパターンを備えたST16の14株を示しました。8つの新規シーケンスタイプ（ST823からST830）と1つの対立遺伝子（GKI95）が中国で初めて特定されました。 結論：OPTRAは、リネゾリド耐性に重要な役割を果たし、耐性スクリーニングのマーカーとして機能する可能性があります。L3とL4変異は同じ株で同時に発生しなかったため、リネゾリッド耐性において無視できる役割を果たします。疫学的調査は、LRE症例が散発的であることを示唆しました。
BACKGROUND: Enterococcus faecalis strains with low-level resistance to linezolid (an oxazolidinone antibiotic) have become common. No large-scale study has examined the underlying mechanisms in linezolid-resistant E. faecalis (LRE) strains. We investigated these mechanisms and molecular characteristics in Chongqing, China. METHODS: A total of 1,120 non-duplicated E. faecalis strains collected from August 2014 to June 2017 underwent drug susceptibility testing. LRE strains were screened for optrA, cfr, and mutations in the 23S rRNA and ribosomal proteins L3 and L4 by PCR amplification and sequencing. Multi-locus sequence typing (MLST) and pulsed-field gel electrophoresis (PFGE) were used for epidemiological analysis. RESULTS: All 43 low-level LRE strains (minimum inhibitory concentration: 8-16 mg/L) harbored optrA; cfr and 23S rRNA mutations were not detected. Novel mutations in the ribosomal proteins L3 and L4-one deletion (Q103del) and four substitutions (S113L, T35A, I98V, and N79D)-were identified. Novel amino acid substitutions at positions E60K, G197D, and T285P of the OptrA protein were observed. MLST revealed 20 types of LRE strains; the most common type was ST16 (32.6%). PFGE showed 14 strains of ST16 with unique banding patterns. Eight novel sequence types (ST823 to ST830) and one allele (gki95) were identified for the first time in China. CONCLUSIONS: optrA plays an important role in linezolid resistance and may serve as a marker for resistance screening. Since the L3 and L4 mutations did not simultaneously occur in the same strain, they play a negligible role in linezolid resistance. Epidemiological investigation suggested that the LRE cases were sporadic.
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