天然同位体存在量での1-メチルアデノシン、7-メチルグアノシン、エテノアデノシン、およびそれらのプロトン化塩IV：1H、13C、および15N NMR研究の比較構造分析

ヌクレオシド1-メチルアデノシン（M1A）、7-メチルグアノシン（M7G）およびエテノアデノシン（EA）の中性およびプロトン化型の1H、13C、および15N NMRスペクトルは、モデル化合物として、サイトを割り当てるために分析されました。M1aおよびM7gのプロトン化の。これらのヌクレオシドのプロトン化は、M1AおよびEAのピリミジン環とM7Gのイミダゾール環に発生し、電荷は局所化されるのではなく分布しています。M1aとM7gの両方の構造の違いは、溶液中に観察され、モノマーの結晶状態およびこれらのヌクレオシドがかなり頻繁に発生するtRNAに存在するものと比較しました。溶液中のプロトン化されたヌクレオシド構造は、X線結晶学データと糖パッカーおよびグリコシド結合の立体構造で好意的に比較されました。プロトン化モノヌクレオシドのメチル基の炭素化学シフトは、天然のtRNA構造におけるそれぞれのヌクレオシドのメチルの炭素化学シフトに対応していました。したがって、TRNAメチル基は、核酸の天然の3次元構造における完全にプロトン化されたヌクレオシドを示しています。

The 1H, 13C, and 15N NMR spectra of neutral and protonated forms of the nucleosides 1-methyladenosine (m1A), 7-methylguanosine (m7G) and ethenoadenosine (EA), as a model compound, have been analyzed in order to assign the site of protonation in m1A and m7G. Protonation of these nucleosides occurs in the pyrimidine ring of m1A and EA and in the imidazole ring of m7G, with the charge being distributed rather than localized. Structural differences for both m1A and m7G were observed in solution and compared with those existing in the crystal state of monomers as well as in tRNA where these nucleosides occur quite often. The protonated nucleoside structures in solution compared favorably in sugar pucker and glycosidic bond conformations with x-ray crystallographic data. Methyl group carbon chemical shifts of the protonated mononucleosides corresponded to those of the methyls of the respective nucleosides in native tRNA structures. Therefore, the tRNA methyl group carbon chemical shifts are indicative of fully protonated nucleosides in the native, three dimensional structure of the nucleic acid.