中国の雲南省におけるB型肝炎ウイルスの遺伝的多様性：新規サブ遺伝子型C17、ジェノタイプ間B/I組換え、およびB/C組換え剤の同定

Yunnanは、中国のいくつかのウイルスの導入、突然変異、組換えの地理的ホットスポットと考えられています。ただし、この領域では、B型肝炎ウイルス（HBV）の遺伝子型プロファイルに関するデータは限られています。この研究では、中国の雲南省の慢性B型肝炎患者から分離された206 HBV株を特徴づけました。1.5 kbシーケンスに基づく最初の遺伝子型は、遺伝子型Cが52.4％（108/206）で最も一般的であり、その後30.6％（63/206）で遺伝子型Bが、17.0％（35/206）で未分類の遺伝子型が続くことが明らかになりました。35の未分類株を特徴付けるために、32の完全なHBVゲノムを増幅して分析しました。17分離株は既知のサブ遺伝子型内で分類され、8はb/c組換え物として分類され、1はb/i組換えとして分類され、6は単系統クラスターの特性に基づいてC17として指定した潜在的に新規Cサブ遺伝型を構成しました。> 4％の遺伝的距離、組換えの有意な証拠はなく、個人間の疫学的リンクはありません。したがって、複数のサブ遺伝子型 - すなわち、B1、B2、B4、C1、C2、C3、C4、C8、およびC17-および2つの異なる遺伝子型組換え剤が中国の雲南に存在し、HBV遺伝子型プロファイルの複雑で多様な分布パターンを強調しています。

Yunnan is considered to be a geographical hotspot for the introduction, mutation and recombination of several viruses in China. However, there are limited data regarding the genotypic profiles of hepatitis B virus (HBV) in this region. In this study, we characterized 206 HBV strains isolated from chronic hepatitis B patients in Yunnan, China. Initial genotyping based on 1.5 kb sequences revealed that genotype C was the most prevalent at 52.4 % (108/206), followed by genotype B at 30.6 % (63/206) and unclassified genotypes at 17.0 % (35/206). To characterize the 35 unclassified strains, 32 complete HBV genomes were amplified and analysed; 17 isolates were classified within a known subgenotype, 8 were classified as B/C recombinants, 1 was classified as a B/I recombinant and 6 constituted a potentially novel C subgenotype that we designated as C17, based on the characteristics of a monophyletic cluster, >4 % genetic distances, no significant evidence of recombination and no epidemiological link among individuals. Thus, multiple subgenotypes - namely B1, B2, B4, C1, C2, C3, C4, C8 and C17 - and two distinct intergenotypic recombinants exist in Yunnan, China, highlighting the complex and diverse distribution pattern of HBV genotypic profiles.