ジェノタイピングごとのパン小麦におけるスポットブロッチ（Cochliobolus sativus）耐性のゲノムワイド関連研究

Spot Brotchは、Cochliobolus sativus（syn。bipolarissorokiniana）によって引き起こされる小麦の重度の生物的脅威です。Spot Blotchは、暖かい湿度の高い地域での大きな利回りの損失を受けやすくなります。159のスプリング小麦遺伝子型のダイバーシティパネルにおけるスポットブロッチ抵抗に関連するゲノム領域を特定するために、ジェノタイピングごとのシーケンス（GBS）マーカーを使用したゲノムワイド関連研究を実施しました。合計で、全ゲノムをカバーする87,096 GBSマーカー、平均的な多型情報コンテンツ値が0.276を適用しました。連鎖不均衡（LD）分析では、LD減衰の範囲が約100 Mbpであることが示されました。このパネルは、2年間、疾患の重症度（DS）と疾患進行曲線下面積（AUDPC）について評価されました。合計で、24のマーカー - 特性関連（MTA）がDSおよびSpot BrotchのAudPCで特定され、11は11枚、3a、3a、6bで2、1a、2a、1d、2d、2d、4b、5aで1つが1つあります。、7a、および7b。染色体7Bのマーカーは、スポットブロッチの重症度とAUDPCの11％の表現型の変動の14％を有意に説明しました。染色体5Bで5つのマーカー3、3Aで1つ、1つはDSとAUDPCの両方に関連付けられ、R2は8〜12％の範囲でした。重要なMTAを利用して、斑点の斑点に耐性を備えた小麦生殖質を発達させることができます。

Spot blotch is a severe biotic menace of wheat caused by Cochliobolus sativus (syn. Bipolaris sorokiniana). Spot blotch is liable to major yield losses in warm humid regions. A genome-wide association study using genotyping-by-sequencing (GBS) markers was conducted to identify genomic regions associated with spot blotch resistance in a diversity panel of 159 spring wheat genotypes. In total, 87,096 GBS markers covering the whole genome, with an average polymorphism information content value of 0.276, were applied. Linkage disequilibrium (LD) analysis indicated that the LD decay extent was approximately 100 Mbp. The panel was evaluated for disease severity (DS) and area under disease progress curve (AUDPC) for 2 years. In total, 24 marker-trait associations (MTA) were identified for DS and AUDPC of spot blotch, with 11 on chromosome 5B, 3 on 3A, 2 on 6B, and 1 each on 1A, 2A, 1D, 2D, 4B, 5A, 7A, and 7B. A marker on chromosome 7B significantly explained 14% of the phenotypic variation of spot blotch severity as well as 11% of AUDPC. Five markers-three on chromosome 5B, one on 3A, and one on 7B-were associated with both DS and AUDPC with R2 ranging from 8 to 12%. Significant MTA can be utilized to develop wheat germplasm with resistance to spot blotch.