Loading...
Archives of virology2019Jan01Vol.164issue(1)

RNAiを介した保護のための豆の共通モザイクウイルス(BCMV)における保存されたポタウイルスモチーフの分子特性と分析

,
,
,
,
文献タイプ:
  • Journal Article
概要
Abstract

オーストラリアの豆の一般的なモザイクウイルス(BCMV)分離株を配列決定し、シーケンスをグローバルなBCMVおよび豆の一般的なモザイク壊死ウイルス(BCMNV)配列と比較し、Planta RNA interference(RNAI)耐性で生成する保存された毒性動力を分析しました。以前に報告された40のポティウイルスモチーフのうち39が、77のBCMV/BCMNVシーケンスすべての中で保存されていました。DSRNAコンストラクト設計用に2つのRNAi標的領域が選択され、920 bpのヌクレアーゼ包含B(NIB)タンパク質と461 bpのコートタンパク質(CP)をカバーしました。77のBCMVおよびBCMNVシーケンスに対する広範囲の防御に対するこれらのコンストラクトの有効性のシリコ予測では、ターゲット領域から生成された推定21ヌクレオチド(NT)および22-NTの小型RNA(SIRNA)の分析を介して行われました。siRNA生成とBCMV RNAiを介した耐性の両方の両方のコンストラクトの有効性は、ニコチアナベンサミアナトランジェントアッセイで検証されました。

オーストラリアの豆の一般的なモザイクウイルス(BCMV)分離株を配列決定し、シーケンスをグローバルなBCMVおよび豆の一般的なモザイク壊死ウイルス(BCMNV)配列と比較し、Planta RNA interference(RNAI)耐性で生成する保存された毒性動力を分析しました。以前に報告された40のポティウイルスモチーフのうち39が、77のBCMV/BCMNVシーケンスすべての中で保存されていました。DSRNAコンストラクト設計用に2つのRNAi標的領域が選択され、920 bpのヌクレアーゼ包含B(NIB)タンパク質と461 bpのコートタンパク質(CP)をカバーしました。77のBCMVおよびBCMNVシーケンスに対する広範囲の防御に対するこれらのコンストラクトの有効性のシリコ予測では、ターゲット領域から生成された推定21ヌクレオチド(NT)および22-NTの小型RNA(SIRNA)の分析を介して行われました。siRNA生成とBCMV RNAiを介した耐性の両方の両方のコンストラクトの有効性は、ニコチアナベンサミアナトランジェントアッセイで検証されました。

Australian bean common mosaic virus (BCMV) isolates were sequenced, and the sequences were compared to global BCMV and bean common mosaic necrosis virus (BCMNV) sequences and analysed for conserved potyviral motifs to generate in planta RNA-interference (RNAi) resistance. Thirty-nine out of 40 previously reported potyvirus motifs were conserved among all 77 BCMV/BCMNV sequences. Two RNAi target regions were selected for dsRNA construct design, covering 920 bp of the nuclease inclusion b (NIb) protein and 461 bp of the coat protein (CP). In silico prediction of the effectiveness of these constructs for broad-spectrum defence against the 77 BCMV and BCMNV sequences was done via analysis of putative 21-nucleotide (nt) and 22-nt small-interfering RNAs (siRNAs) generated from the target regions. The effectiveness of both constructs for siRNA generation and BCMV RNAi-mediated resistance was validated in Nicotiana benthamiana transient assays.

医師のための臨床サポートサービス

ヒポクラ x マイナビのご紹介

無料会員登録していただくと、さらに便利で効率的な検索が可能になります。

Translated by Google