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International journal of systematic and evolutionary microbiology2018Dec01Vol.68issue(12)

Zobellella Endophytica sp nov、クムタグ砂漠のphragmites communisの根から分離

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文献タイプ:
  • Journal Article
概要
Abstract

59N8T株と名付けられたグラム陰性、好気性、非胞子形成、棒状、運動性菌は、クムタグ砂漠のcommunisの根から分離されました。16S RRNA遺伝子配列に基づく系統解析により、分離株はアエロモナ科科内のゾベレラ属に属することが示されました。分析では、59N8T株がZobellella taiwanensis ZT1Tと最も密接に関連していることが示されました。Zobellella taiwanensis ZT1Tの平均ヌクレオチド同一性値は88.2%で、デジタルDNA-DNAハイブリダイゼーション値は29.7±2.4%であり、ゲノムからゲノム距離計算機を使用して計算されました。株59N8TのG+C含有量は62.8 mol%でした。株59N8Tは0-5%(w/v)NaCl(最適、0-4%)、pH 6.0-9.0(最適、7.0-8.0)、10-45°Cで成長しました。主要な細胞脂肪酸を合計された特徴8(C18:1Ω7C/C18:1Ω6C)、合計3(C16:1Ω7C/C16:1Ω6C)、C16:0。走化性、系統学的、表現型データに基づいて、59N8T株はZobellella属の新規種を表し、Zobellellaendophytica sp。11月。提案されています。型ひずみは59n8t(= accc 60074t = kctc 62456t)です。

59N8T株と名付けられたグラム陰性、好気性、非胞子形成、棒状、運動性菌は、クムタグ砂漠のcommunisの根から分離されました。16S RRNA遺伝子配列に基づく系統解析により、分離株はアエロモナ科科内のゾベレラ属に属することが示されました。分析では、59N8T株がZobellella taiwanensis ZT1Tと最も密接に関連していることが示されました。Zobellella taiwanensis ZT1Tの平均ヌクレオチド同一性値は88.2%で、デジタルDNA-DNAハイブリダイゼーション値は29.7±2.4%であり、ゲノムからゲノム距離計算機を使用して計算されました。株59N8TのG+C含有量は62.8 mol%でした。株59N8Tは0-5%(w/v)NaCl(最適、0-4%)、pH 6.0-9.0(最適、7.0-8.0)、10-45°Cで成長しました。主要な細胞脂肪酸を合計された特徴8(C18:1Ω7C/C18:1Ω6C)、合計3(C16:1Ω7C/C16:1Ω6C)、C16:0。走化性、系統学的、表現型データに基づいて、59N8T株はZobellella属の新規種を表し、Zobellellaendophytica sp。11月。提案されています。型ひずみは59n8t(= accc 60074t = kctc 62456t)です。

A Gram-negative, aerobic, non-spore-forming, rod-shaped, motile bacterium, named strain 59N8T, was isolated from Phragmites communis roots in the Kumtag Desert. Phylogenetic analysis based on the 16S rRNA gene sequence showed that the isolate belongs to the genus Zobellella within the family Aeromonadaceae. The analysis showed that strain 59N8T was most closely related to Zobellella taiwanensis ZT1T. The average nucleotide identity value with Zobellella taiwanensis ZT1T was 88.2 %, and the digital DNA-DNA hybridization value was 29.7±2.4 %, which was calculated using the Genome-to-Genome Distance Calculator. The G+C content of strain 59N8T was 62.8 mol%. Strain 59N8T grew at 0-5 % (w/v) NaCl (optimum, 0-4 %), pH 6.0-9.0 (optimum, 7.0-8.0) and at 10-45 °C. The major cellular fatty acids were summed feature 8 (C18 : 1ω7c/C18 : 1ω6c), summed feature 3 (C16 : 1ω7c/C16 : 1ω6c) and C16 : 0. The major polar lipids in strain 59N8T were phosphatidylethanolamine and phosphatidylglycerol. Based on the chemotaxonomic, phylogenetic and phenotypic data, strain 59N8T represents a novel species in the genus Zobellella, for which the name Zobellellaendophytica sp. nov. is proposed. The type strain is 59N8T (=ACCC 60074T=KCTC 62456T).

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