頻繁に独立した重複転置は、単一のVSG遺伝子を活性化します

Bruceiトリパノソーマにおけるいくつかの表面抗原遺伝子の発現は、塩基性コピーバリアント表面糖タンパク質（VSG）遺伝子の重複する転位によって発現部位に媒介されます。寄生虫血症におけるバリアント118の出現は、同じVSG 118遺伝子の少なくとも4つの独立した重複転置に起因すると判断しました。バリアント117と118はどちらも特定の期間に登場しましたが、複数の独立した活性化に起因しました。したがって、抗原変異体は順序付けられた方法で発生します。VSG遺伝子の重複転置では、転置されたセグメントの端が基本コピーと発現部位の間で相同であることを示します。以前に報告された70ベースペア（BP）リピート以外のシーケンスが関与する可能性があります。1つのバリアント、118クローン1では、相同性は、以前に発現部位に転置された配列と、VSG 118遺伝子の上流6キロベースに位置する配列の間にありました。バリアント118bでは、相同性はおそらく70 bpの繰り返しアレイであったが、3番目の118バリアントではさらに別のシーケンスが関与していた。再結合イベントの最初のステップで70 bpの繰り返しが重要である可能性は、70 bpの繰り返しアレイを含む再配列によって示されました。データは、遺伝子変換がVSG遺伝子の重複転置を媒介するという概念の強力な証拠を提供します。重複する転位のプロセスがランダムにどのように発生し、バリアントの順序付けられた外観を生成するかを説明するモデルについて説明します。

The expression of several surface antigen genes in Trypanosoma brucei is mediated by the duplicative transposition of a basic-copy variant surface glycoprotein (VSG) gene into an expression site. We determined that the appearance of variant 118, in a parasitemia, resulted from at least four independent duplicative transpositions of the same VSG 118 gene. Variants 117 and 118 both appeared at specific periods but resulted from multiple independent activations. Antigenic variants thus occur in an ordered manner. We show that in the duplicative transpositions of VSG genes, the ends of the transposed segments were homologous between the basic copy and the expression site. Sequences other than the previously reported 70-base-pair (bp) repeats could be involved. In one variant, 118 clone 1, the homology was between a sequence previously transposed into the expression site and a sequence located 6 kilobases upstream of the VSG 118 gene. In variant 118b the homology was presumably in 70-bp repeat arrays, while in a third 118 variant yet another sequence was involved. The possibility that the 70-bp repeats are important in the initial steps of the recombinational events was illustrated by a rearrangement involving a 70-bp repeat array. The data provide strong evidence for the notion that gene conversion mediates the duplicative transposition of VSG genes. We discuss a model that explains how the process of duplicative transposition can occur at random and still produce an ordered appearance of variants.