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Current computer-aided drug design20190101Vol.15issue(1)

潜在的な抗がん剤としてのカスパーゼ-3アクティベーターの分子ドッキング分析

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文献タイプ:
  • Journal Article
概要
Abstract

はじめに:カスパーゼ-3はアポトーシスと活性化において主導的な役割を果たし、細胞内の多くのタンパク質基質を切断し、細胞死を引き起こします。多くの化学療法は癌細胞にアポトーシスを誘導することが知られているため、標的化アポトーシス調節因子を介したアポトーシスの促進または活性化は、抗がんの創薬の有望な戦略として示唆されています。この論文では、1,2,4-オキサジアゾール誘導体と抗がん薬標的酵素(PDB ID 3SRC)との相互作用を研究しました。 方法:一連の1,2,4-オキサジアゾール誘導体で分子ドッキング研究を実施して、カスパーゼ-3酵素のアゴニズムの親和性の結合潜在性の分子配置と空間的要件を調べました。AutoDock 4.2およびGold 5.2分子モデリングスイートを分子ドッキング分析に使用して、重要な薬物受容体相互作用に関する情報を提供しました。 結果と結論:両方のスイートは、酵素のリガンド結合ドメインに活性アミノ酸を伴う薬物の空間的性質を説明しました。ターゲットのアミノ酸アスパラギン273(ASN 273)は、上位ランクのリガンドとの水素結合相互作用を示しています。

はじめに:カスパーゼ-3はアポトーシスと活性化において主導的な役割を果たし、細胞内の多くのタンパク質基質を切断し、細胞死を引き起こします。多くの化学療法は癌細胞にアポトーシスを誘導することが知られているため、標的化アポトーシス調節因子を介したアポトーシスの促進または活性化は、抗がんの創薬の有望な戦略として示唆されています。この論文では、1,2,4-オキサジアゾール誘導体と抗がん薬標的酵素(PDB ID 3SRC)との相互作用を研究しました。 方法:一連の1,2,4-オキサジアゾール誘導体で分子ドッキング研究を実施して、カスパーゼ-3酵素のアゴニズムの親和性の結合潜在性の分子配置と空間的要件を調べました。AutoDock 4.2およびGold 5.2分子モデリングスイートを分子ドッキング分析に使用して、重要な薬物受容体相互作用に関する情報を提供しました。 結果と結論:両方のスイートは、酵素のリガンド結合ドメインに活性アミノ酸を伴う薬物の空間的性質を説明しました。ターゲットのアミノ酸アスパラギン273(ASN 273)は、上位ランクのリガンドとの水素結合相互作用を示しています。

INTRODUCTION: Caspase-3 plays a leading role in apoptosis and on activation, it cleaves many protein substrates in cells and causes cell death. Since many chemotherapeutics are known to induce apoptosis in cancer cells, promotion or activation of apoptosis via targeting apoptosis regulators has been suggested as a promising strategy for anticancer drug discovery. In this paper, we studied the interaction of 1,2,4-Oxadiazoles derivatives with anticancer drug target enzymes (PDB ID 3SRC). METHODS: Molecular docking studies were performed on a series of 1,2,4-Oxadiazoles derivatives to find out molecular arrangement and spatial requirements for their binding potential for caspase-3 enzyme agonistic affinity to treat cancer. The Autodock 4.2 and GOLD 5.2 molecular modeling suites were used for the molecular docking analysis to provide information regarding important drug receptor interaction. RESULTS AND CONCLUSION: Both suites explained the spatial disposition of the drug with the active amino acid in the ligand binding domain of the enzyme. The amino acid asparagine 273 (ASN 273) of target has shown hydrogen bond interaction with the top ranked ligand.

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