SD-CHIP有効化デジタル核酸配列ベースの増幅（DNASBA）を使用したHIV RNAの定量的検出

RNAの定量的検出は、分子生物学と臨床診断において重要です。一本鎖RNAを増幅するための単一ステップの方法である核酸配列ベースの増幅（NASBA）は、RT-PCRと同じくらい敏感な等温技術であるため、ポイントオブケア（POC）診断で使用するのに魅力的です。反応時間が短い。ただし、NASBAは、ウイルス量やRNAコピー数など、正確な定量的情報を提供する能力が限られています。ここでは、自己司法（SD）チッププラットフォームを使用してNASBA（DNASBA）のデジタル形式をテストし、HIV-1 RNAの定量化に適用します。Dnasbaは、リアルタイムの定量的Nasbaよりも敏感で正確であり、血漿サンプルのHIV-1 RNAを定量化するために使用できることを実証します。したがって、デジタルナスバは、リソース制限設定で使用するための有望なPOC診断ツールです。

Quantitative detection of RNA is important in molecular biology and clinical diagnostics. Nucleic acid sequence-based amplification (NASBA), a single-step method to amplify single-stranded RNA, is attractive for use in point-of-care (POC) diagnostics because it is an isothermal technique that is as sensitive as RT-PCR with a shorter reaction time. However, NASBA is limited in its ability to provide accurate quantitative information, such as viral load or RNA copy number. Here we test a digital format of NASBA (dNASBA) using a self-digitization (SD) chip platform, and apply it to quantifying HIV-1 RNA. We demonstrate that dNASBA is more sensitive and accurate than the real-time quantitative NASBA, and can be used to quantify HIV-1 RNA in plasma samples. Digital NASBA is thus a promising POC diagnostics tool for use in resource-limited settings.