mRNAの修正を検出するための誤った署名：それが聞こえるほど単純ではない

mRNAの転写後の修飾は近年、強い関心のある分野となっており、次世代シーケンスベースのテクノロジーは、トランスクリプトーム全体のレベルで増加する数の修正を検出するために絶えず現れています。これらのアプローチのいくつかは、修正部位で逆転写酵素によって誘導される誤った組み込みイベントの識別に基づいています。このようなイベントの概念的に些細な、繊細で具体的な識別は、驚くべき数のアーティファクトに起因する挑戦であり、多様な修正の豊富さの実質的に膨らんだ推定につながる可能性があります。ここでは、これらのアーティファクトのいくつかのソースについて説明し、それらを克服するためのアプローチを描きます。

Post-transcriptional modification on mRNA has become a field of intense interest in recent years, and next-generation sequencing based technologies are constantly emerging to detect an increasing number of modifications at a transcriptome-wide level. Some of these approaches are based on identification of misincorporation events induced by reverse transcriptase at modified sites. Although conceptually trivial, sensitive and specific identification of such events is a challenge prone to a surprising number of artifacts, which can lead to substantially inflated estimates of the abundance of diverse modifications. Here we discuss the sources of some of these artifacts and delineate approaches to overcome them.