Genbank

Genbank®（www.ncbi.nlm.nih.gov/genbank/）は、420 ​​000の正式に記述された種の公開されたヌクレオチド配列を含む包括的なデータベースです。ほとんどのGenBankの提出物は、BankIT、NCBI提出ポータル、またはツールTBL2ASNを使用して行われ、個々の研究所から得られ、全ゲノムショットガン（WGS）や環境サンプリングプロジェクトを含む大規模なシーケンスプロジェクトからバッチ提出物から取得されます。欧州ヌクレオチドアーカイブ（ENA）と日本のDNAデータバンク（DDBJ）との毎日のデータ交換により、世界中のカバレッジが保証されています。GenBankは、PubMedの分類、ゲノム、タンパク質配列と構造、生物医学ジャーナル文献などの関連情報にリンクするNCBIヌクレオチドデータベースからアクセスできます。BLASTは、GenBankおよびその他のシーケンスデータベースのシーケンス類似性検索を提供します。GenBankデータベースの完全なバカリリリースと毎日の更新は、FTPが利用できます。最近の更新には、予想されるデータベースの成長に対応するためのシーケンス識別子形式の拡張、リボソームRNAの提出ウィザード、ヌクレオチドデータベースへの発現シーケンスタグ（EST）およびゲノム調査シーケンス（GSS）データの転送が含まれます。

GenBank® (www.ncbi.nlm.nih.gov/genbank/) is a comprehensive database that contains publicly available nucleotide sequences for 420 000 formally described species. Most GenBank submissions are made using BankIt, the NCBI Submission Portal, or the tool tbl2asn, and are obtained from individual laboratories and batch submissions from large-scale sequencing projects, including whole genome shotgun (WGS) and environmental sampling projects. Daily data exchange with the European Nucleotide Archive (ENA) and the DNA Data Bank of Japan (DDBJ) ensures worldwide coverage. GenBank is accessible through the NCBI Nucleotide database, which links to related information such as taxonomy, genomes, protein sequences and structures, and biomedical journal literature in PubMed. BLAST provides sequence similarity searches of GenBank and other sequence databases. Complete bimonthly releases and daily updates of the GenBank database are available by FTP. Recent updates include an expansion of sequence identifier formats to accommodate expected database growth, submission wizards for ribosomal RNA, and the transfer of Expressed Sequence Tag (EST) and Genome Survey Sequence (GSS) data into the Nucleotide database.