アフリカの角の患者からの多剤耐性「マイコバクテリウムシミュラン」および結核菌の肺の分離

アフリカの角の低所得国では、肺感染症は通常結核と見なされ、診断は臨床データと陽性顕微鏡観察に依存しています。この戦略により、結核性のないマイコバクテリアが検出を逃れることができ、集団への出現を促進します。結核性の多いマイコバクテリウム株FB-527は、多剤耐性（MDR）結核と診断されたジブチアン患者のsputから予期せず培養されました。RPOBおよび16S RRNA遺伝子のシーケンスは、分離株が以前に「Mycobacterium Simulans」という名前のFI-09026株と同一であることを示し、ソマリア患者から一度だけ報告しました。株FB-527は、API ZYMストリップを使用して結核性コロニーと酵素プロファイルを模倣し、リファンピシンとイソニアジドに耐性がありました。2つのMDR Mycobacteriaの分離により、患者の診断と治療管理が複雑になりました。ここでは、ゲノムシーケンスを含む株FB-527および株FI-09026の完全な説明について報告し、提案された新種「Mycobacterium simulans」の説明を確定します。

In low-income countries of the Horn of Africa, pulmonary infections are usually considered as tuberculosis, which diagnosis relies on clinical data and positive microscopic observation. This strategy allows non-tuberculous mycobacteria to escape detection, facilitating their emergence in populations. A non-tuberculous mycobacterium strain FB-527 was unexpectedly cultured from the sputum of a Djiboutian patient otherwise diagnosed with multi-drug resistant (MDR) tuberculosis. The sequencing of the rpoB and 16S rRNA genes showed that the isolate was identical to strain FI-09026 previously named "Mycobacterium simulans" and reported only once from a Somali patient. Strain FB-527 mimicked Mycobacterium tuberculosis colonies and enzymatic profile using API ZYM strip and was in vitro resistant to rifampicin and isoniazid. Isolation of two MDR mycobacteria complicated the diagnosis and therapeutic management of the patient. We here report on the complete description of strain FB-527 and strain FI-09026 including genome sequencing, finalizing the description of the proposed new species "Mycobacterium simulans".