ホモシステインで処理されたヒト網膜細胞における円形RNA分子の発現分析

目的：ヒト網膜色素上皮（RPE）細胞の系統であるホモシステイン（HCY）で処理されたARPE-19細胞における循環RNA（CIRCRNA）のグローバルなプロファイルを特徴付ける。 材料と方法：HCYの有無にかかわらずARPE-19細胞を治療して、専用のヒトシルナマイクロアレイを使用してCircRNA発現レベルに対するHCYの影響を調査しました。 結果：合計12,233個のシルナが特定されました。54は差次的に発現し（17はダウンレギュレートされ、37はアップレギュレートされました）、HCY処理対未処理細胞では2.0> 2.0（p <0.05）を変化させました。 結論：私たちの知る限り、これは、網膜生物学と視力に悪影響を与える高ホモサチン血症（HHCY）条件を模倣したHCY治療後のヒトRPE細胞のCIRCRNAをプロファイリングする最初のレポートです。これらの発見は、HCY代謝とHHCYを介した疾患を理解し、HCY濃度の上昇によって引き起こされる眼疾患の潜在的な診断および治療標的を特定するのに役立つため、潜在的な臨床的意義があります。

PURPOSE: To characterize the global profile of circular RNAs (circRNAs) and their differential expression levels in homocysteine (Hcy)-treated ARPE-19 cells, a line of human retinal pigment epithelial (RPE) cells. MATERIALS AND METHODS: We treated ARPE-19 cells with and without Hcy to investigate the influence of Hcy on circRNA expression levels using dedicated human circRNA microarrays. RESULTS: A total of 12,233 circRNAs were identified out of them 54 were differentially expressed (17 were down-regulated, and 37 were up-regulated) with a fold change >2.0 (p < 0.05) in Hcy-treated versus untreated cells. CONCLUSIONS: To our knowledge, this is the first report profiling circRNAs in human RPE cells post-Hcy treatment mimicking hyperhomocysteinemic (HHcy) conditions that negatively affect retinal biology and vision. These findings are of potential clinical significance as they will help understand Hcy metabolism and HHcy-mediated diseases and identify potential diagnostic and therapeutic targets for eye diseases that are caused by elevated Hcy concentrations.