エピトープベースのペプチドワクチンの設計と、新興オロプーシュウイルスのポリタンパク質に対する活性部位予測のための免疫情報学アプローチ

Oropouche Virus（OROV）は、ヒトのオロプーチ発熱と髄膜炎を引き起こす新興病原体です。南アメリカ、特にブラジルでのオロフのいくつかの発生により、新興病としての状態が変化しましたが、ワクチンや特定の薬物標的はまだ利用できません。私たちのアプローチは、免疫情報学を使用して、エピトープベースのワクチン候補とリガンド結合ポケットを特定することでした。このレポートでは、最も抗原性オロフポリタンパク質のT細胞とB細胞の両方のエピトープを、液性免疫と細胞を介した免疫の両方を誘導する可能性を特定しました。潜在的なワクチン候補として3つの100％保存されたエピトープ（Tsswgceey、csmcglihy、およびLaidtgcly）を含む、18の高抗原性および免疫原性CD8+ T細胞エピトープが確認されました。選択されたエピトープは、ブラジルの混合人口に対して95.77％のカバレッジを示しました。ドッキングシミュレーションにより、親和性が高い結合相互作用が保証されました。合計5つの高度に保存されていない非毒性の線形B細胞エピトープ「nqkidlsql」、「hplstsqigdrc」、「shcnleftaitadkimsl」、「pekipakegwltssw」、および「hhykptknlphvvvvvpryh」が潜在的なワクシン候補として選択されました。予測される8つの立体配座B細胞エピトープは、入力されたウイルスのアクセシビリティを表しています。治療後の戦略では、出現するOROV感染に対する効果的な阻害剤設計のために、10のリガンド結合ポケットが特定されました。集合的に、この研究は、OroVに対するエピトープベースのペプチドワクチン設計の新しい候補を提供します。

Oropouche virus (OROV) is an emerging pathogen which causes Oropouche fever and meningitis in humans. Several outbreaks of OROV in South America, especially in Brazil, have changed its status as an emerging disease, but no vaccine or specific drug target is available yet. Our approach was to identify the epitope-based vaccine candidates as well as the ligand-binding pockets through the use of immunoinformatics. In this report, we identified both T-cell and B-cell epitopes of the most antigenic OROV polyprotein with the potential to induce both humoral and cell-mediated immunity. Eighteen highly antigenic and immunogenic CD8+ T-cell epitopes were identified, including three 100% conserved epitopes (TSSWGCEEY, CSMCGLIHY, and LAIDTGCLY) as the potential vaccine candidates. The selected epitopes showed 95.77% coverage for the mixed Brazilian population. The docking simulation ensured the binding interaction with high affinity. A total of five highly conserved and nontoxic linear B-cell epitopes "NQKIDLSQL," "HPLSTSQIGDRC," "SHCNLEFTAITADKIMSL," "PEKIPAKEGWLTFSKEHTSSW," and "HHYKPTKNLPHVVPRYH" were selected as potential vaccine candidates. The predicted eight conformational B-cell epitopes represent the accessibility for the entered virus. In the posttherapeutic strategy, ten ligand-binding pockets were identified for effective inhibitor design against emerging OROV infection. Collectively, this research provides novel candidates for epitope-based peptide vaccine design against OROV.