SDAB-DB：単一ドメイン抗体データベース

単一ドメイン抗体データベース、またはSDAB-DB（www.sdab-db.ca）は、単一ドメイン抗体および関連クラスのタンパク質の最初の自由に利用可能なリポジトリです。サイズが小さいため、モジュール構造、および表現の容易さにより、単一ドメイン抗体（SDAB）には、合理的な設計ツールを含む幅広い用途があり、したがって、合成生物学者やバイオエンジニアにとって大きな関心があります。ただし、既存のSDABの効果的な使用と共有を可能にするには、エンジニアリング機能（たとえば、蛍光タンパク質を備えた融合）、および新しいSDABの合理的な設計とエンジニアリングを含むため、シーケンスと実験データにアクセスする必要があります。したがって、SDABに焦点を当てた公開データベースを開発し、タンパク質データベース、公開された科学記事、ユーザーの提出から手動でキュレーションされたSDABデータへのアクセスを提供しました。SDAB-DBは、SDABコミュニティ向けのオープンソースリポジトリおよび共有プラットフォームであり、以前に記載および検証されたSDABで使用するパフォーマンスデータと基本的なバイオインフォマティックツールへのアクセスを提供し、新しいSDABベースのデザインとタンパク質のエンジニアリングに提供します。

The Single Domain Antibody Database, or sdAb-DB, ( www.sdab-db.ca ) is the first freely available repository for single domain antibodies and related classes of proteins. Due to their small size, modular structure, and ease of expression, single domain antibodies (sdAb) have a wide range of applications, including as a rational design tool, and are therefore of great interest for synthetic biologists and bioengineers. However, to enable effective use and sharing of existing sdAbs, including those with engineered functions ( e.g., fusions with fluorescent proteins), as well as the rational design and engineering of new sdAbs, it is necessary to have access to sequences and experimental data. We have therefore developed a publicly available, sdAb-focused database, providing access to manually curated sdAb data from protein databases, published scientific articles, and user submissions. The sdAb-DB is an open-source repository and sharing platform for the sdAb community, providing access to performance data and basic bioinformatic tools for use with previously described and validated sdAbs, as well as for the engineering of new sdAb-based designs and proteins.