RNAポリメラーゼIIによる転写は、酵母のDNAトポロジの変化を誘発します

酵母プラスミドで負担するCYC1-LACZ融合遺伝子の転写の誘導が、約5回転の陰性超肝性の増加を引き起こすことを示しています。この増加は、CYC1プロモーター、上流の活性化サイト（UAS）、またはTATAボックスのいずれかの必須要素の削除によって廃止されます。いくつかの実験は、増加のサイズが転写された領域のサイズに比例していることを示しています。第一に、CYC1-LACZ転写領域の半分を除去する内部削除は、誘導に対する負の超肝性がプロモーター削除プラスミドと親プラスミドの中間であるプラスミドをもたらします。第二に、推定CYC1ターミネーターをCYC1-LACZ融合遺伝子に含むフラグメントの挿入を担うプラスミドは、生成された切り捨てられた融合転写産物の長さに比例した相対的な負の超依存性を持っています。これらの観察結果を説明するもっともらしいモデルは、RNAポリメラーゼを転写することにより二重らせんの局所巻き戻しが積極的にスーパーコイル化されたDNAを生成し、その後トポイソメラーゼによって緩和されることです。

We show that induction of transcription of a CYC1-lacZ fusion gene, borne on a yeast plasmid, causes an increase in negative superhelicity of approximately five turns. This increase is abolished by deletion of either essential element of the CYC1 promoter, the upstream activation site (UAS), or the TATA boxes. Several experiments indicate that the size of the increase is proportional to the size of the transcribed region. First, an internal deletion removing half of the CYC1-lacZ transcribed region results in a plasmid whose negative superhelicity on induction is intermediate between promoter-deletion plasmids and the parental plasmid. Second, plasmids bearing insertions of a fragment containing the putative CYC1 terminator into the CYC1-lacZ fusion gene have relative negative superhelicities proportional to the length of the truncated fusion transcripts generated. A plausible model explaining these observations is that local unwinding of the double helix by transcribing RNA polymerase generates positively supercoiled DNA, which is subsequently relaxed by a topoisomerase.