タンパク質アセチル化分析の現在の傾向

アセチル化は、多くの細胞生理学的および病理学的プロセスで重要な役割を果たすタンパク質の広く発生する翻訳後修飾（PTM）です。過去10年間で、アセチル化分析では、個々のアセチル化タンパク質を標的とする複数の方法の開発が必要であり、アセチロームを含むアセチル化タンパク質のより広範な説明をカバーする必要がありました。カバーされた領域：このレビューでは、さまざまな種類のアセチル化（N-TER/K-/O-アセチル化）について説明し、タンパク質のアセチル化を検出、豊富、識別、特定、定量化するために文献で報告されているいくつかの主要な戦略について説明します。このレビューは、これらの戦略の利点と制限を強調し、研究者が実験的調査とタンパク質アセチル化の分析を設計する際に導きます。最後に、このレビューは、生理学的および病理学的状態を理解するためのアセチロミクス（質量分析に基づくプロテオミクス）の主な応用を強調しています。専門家の意見：アセチロミクスの最近の進歩により、タンパク質アセチル化とアセチルムの生物学的および病理学的役割に関する知識が向上しています。その上、放射性標識とウエスタンブロッティングは、標的タンパク質のアセチル化の選択技術も残っています。n-ertとk-アセチロームを分析するためのアセチロミクスの将来の課題では、濃縮/分別、MS機器、バイオインフォマティクスが必要になる可能性が高いでしょう。また、O-アセチル化の潜在的な生物学的役割と他のPTMとのクロストークを特定する課題も残っています。

Acetylation is a widely occurring post-translational modification (PTM) of proteins that plays a crucial role in many cellular physiological and pathological processes. Over the last decade, acetylation analyses required the development of multiple methods to target individual acetylated proteins, as well as to cover a broader description of acetylated proteins that comprise the acetylome. Areas covered: This review discusses the different types of acetylation (N-ter/K-/O-acetylation) and then describes some major strategies that have been reported in the literature to detect, enrich, identify and quantify protein acetylation. The review highlights the advantages and limitations of these strategies, to guide researchers in designing their experimental investigations and analysis of protein acetylation. Finally, this review highlights the main applications of acetylomics (proteomics based on mass spectrometry) for understanding physiological and pathological conditions. Expert opinion: Recent advances in acetylomics have enhanced knowledge of the biological and pathological roles of protein acetylation and the acetylome. Besides, radiolabeling and western blotting remain also techniques-of-choice for targeted protein acetylation. Future challenges in acetylomics to analyze the N-ter and K-acetylome will most likely require enrichment/fractionation, MS instrumentation and bioinformatics. Challenges also remain to identify the potential biological roles of O-acetylation and cross-talk with other PTMs.