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Cell metabolism2019Mar05Vol.29issue(3)

膵島のシングルセルRNAセック - まだ満たされていない約束ですか?

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文献タイプ:
  • Journal Article
  • Research Support, N.I.H., Extramural
  • Review
概要
Abstract

過去3年間で、マウスとヒトからの膵島の単一細胞RNAシーケンス(RNA-seq)分析に関する出版物が大量に見られました。この技術は、細胞型シグネチャを改良し、グルカゴン生産αやインスリン生産β細胞などの標準内分泌細胞タイプの細胞不均一性を発見し、新しいサブタイプを示唆する限り進むという約束を抱えています。さらに、単一細胞RNA-Seqには、以前のバルク分析によって捕捉されないまれな内分泌細胞タイプを特徴付ける能力があります。個々の内分泌細胞からのトランスクリプトミクスデータを使用すると、発達プロセスに沿って、および代謝疾患の出現中に細胞状態をプロファイルできます。しかし、この新しいテクノロジーの約束はまだ完全に満たされていません。方法論は初めて、グレリン産生細胞などのまれな内分泌細胞タイプの転写定義を有効にしましたが、2型糖尿病の細胞型特異的遺伝子発現変化に関する結論のいくつかは、より大きなサンプルサイズが利用可能になると再検討する必要があるかもしれません。データの生成と分析は、単一細胞RNA-Seqアプローチを継続的に改善しており、発達、代謝課題、および疾患中の膵島細胞の(mal)適応を理解するのに役立ちます。

過去3年間で、マウスとヒトからの膵島の単一細胞RNAシーケンス(RNA-seq)分析に関する出版物が大量に見られました。この技術は、細胞型シグネチャを改良し、グルカゴン生産αやインスリン生産β細胞などの標準内分泌細胞タイプの細胞不均一性を発見し、新しいサブタイプを示唆する限り進むという約束を抱えています。さらに、単一細胞RNA-Seqには、以前のバルク分析によって捕捉されないまれな内分泌細胞タイプを特徴付ける能力があります。個々の内分泌細胞からのトランスクリプトミクスデータを使用すると、発達プロセスに沿って、および代謝疾患の出現中に細胞状態をプロファイルできます。しかし、この新しいテクノロジーの約束はまだ完全に満たされていません。方法論は初めて、グレリン産生細胞などのまれな内分泌細胞タイプの転写定義を有効にしましたが、2型糖尿病の細胞型特異的遺伝子発現変化に関する結論のいくつかは、より大きなサンプルサイズが利用可能になると再検討する必要があるかもしれません。データの生成と分析は、単一細胞RNA-Seqアプローチを継続的に改善しており、発達、代謝課題、および疾患中の膵島細胞の(mal)適応を理解するのに役立ちます。

In the past 3 years, we have seen a flurry of publications on single-cell RNA sequencing (RNA-seq) analyses of pancreatic islets from mouse and human. This technology holds the promise to refine cell-type signatures and discover cellular heterogeneity among the canonical endocrine cell types such as the glucagon-producing α and insulin-producing β cells, going as far as suggesting new subtypes. In addition, single-cell RNA-seq has the ability to characterize rare endocrine cell types that are not captured by prior bulk analysis. With transcriptomics data from individual endocrine cells, cellular states can be profiled both along developmental processes and during the emergence of metabolic diseases. However, the promises of this new technology have not yet been met in full. While the methodology for the first time enabled the transcriptional definition of rare endocrine cell types such as ghrelin-producing ɛ cells, some of the conclusions regarding cell-type-specific gene expression changes in type 2 diabetes might need to be revisited once larger sample sizes become available. Data generation and analysis are continuously improving single-cell RNA-seq approaches and are helping us to understand the (mal)adaptations of the islet cells during development, metabolic challenge, and disease.

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