Scope-seq：ライブセルイメージングとシングルセルRNAシーケンスをリンクするためのスケーラブルな技術

光学的にデコード可能なビーズは、サンプルのアイデンティティを光バーコードを介して測定にリンクし、生体分子のライブラリを溶液中のビーズにキャプチャし、蛍光によってデコードできるようにします。このアプローチは、マイクロアレイ、シーケンス、フローベースの表現プロファイリング技術の基礎となっています。マイクロ流体と光学的にデコード可能なビーズを組み合わせて、生細胞の表現型分析が単一細胞シーケンスにリンクできることを示します。概念実証として、ライブセルイメージングとシングルセルRNAシーケンスを組み合わせて、単一細胞光学表現型と発現シーケンス（スコープセック）と呼ばれるツールの精度とスケーラビリティを実証します。

Optically decodable beads link the identity of a sample to a measurement through an optical barcode, enabling libraries of biomolecules to be captured on beads in solution and decoded by fluorescence. This approach has been foundational to microarray, sequencing, and flow-based expression profiling technologies. We combine microfluidics with optically decodable beads and show that phenotypic analysis of living cells can be linked to single-cell sequencing. As a proof-of-concept, we demonstrate the accuracy and scalability of our tool called Single Cell Optical Phenotyping and Expression sequencing (SCOPE-Seq) to combine live cell imaging with single-cell RNA sequencing.