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すると翻訳の精度が向上します
C型肝炎ウイルス（HCV）ゲノムには、ウイルスRNA翻訳および複製プロセスにおいて重要な調節役割を果たすと考えられる構造化された要素が含まれています。in vitro RNA結合アッセイを使用して、NS5BのHCV 5'UTRおよび遠位配列を含む相互作用をマッピングして、ウイルスRNA複製への影響を調べました。データは、内部リボソーム侵入部位（IRES）ドメインIIAの5'UTRヌクレオチド（NT）95⁻110と、RNA依存性RNAポリメラーゼコーディング領域NS5BにあるNTシーケンス8528⁻8543を一致させることを明らかにしました。-RNA複合体でin vitro。このデュプレックスは、ウォブルとワトソンの両方のベースペアリングで構成されており、後者は高親和性デュプレックスの形成に不可欠であることが示されています。HCVゲノムRNA構築物は、ドメインIIA NT95⁻110またはNT8528⁻8543を含むゲノムRNA位置内に、平均して5倍少ない細胞内HCV RNAと6倍の感染性子孫ウイルスを含むゲノムRNA位置内に含まれています。IRESドメインIIA NT95⁻110およびNS5B NT8528⁻8543の補完的変異を含むHCVゲノム構築物は、親ウイルスRNAについて得られたレベルまでの細胞内HCV RNAおよび子孫ウイルス力価を回復しました。IRESドメインIIAとNS5B NT8528⁻8543の間のこの長距離二重相互作用は、最適なウイルス複製に不可欠であると結論付けています。
C型肝炎ウイルス（HCV）ゲノムには、ウイルスRNA翻訳および複製プロセスにおいて重要な調節役割を果たすと考えられる構造化された要素が含まれています。in vitro RNA結合アッセイを使用して、NS5BのHCV 5'UTRおよび遠位配列を含む相互作用をマッピングして、ウイルスRNA複製への影響を調べました。データは、内部リボソーム侵入部位（IRES）ドメインIIAの5'UTRヌクレオチド（NT）95⁻110と、RNA依存性RNAポリメラーゼコーディング領域NS5BにあるNTシーケンス8528⁻8543を一致させることを明らかにしました。-RNA複合体でin vitro。このデュプレックスは、ウォブルとワトソンの両方のベースペアリングで構成されており、後者は高親和性デュプレックスの形成に不可欠であることが示されています。HCVゲノムRNA構築物は、ドメインIIA NT95⁻110またはNT8528⁻8543を含むゲノムRNA位置内に、平均して5倍少ない細胞内HCV RNAと6倍の感染性子孫ウイルスを含むゲノムRNA位置内に含まれています。IRESドメインIIA NT95⁻110およびNS5B NT8528⁻8543の補完的変異を含むHCVゲノム構築物は、親ウイルスRNAについて得られたレベルまでの細胞内HCV RNAおよび子孫ウイルス力価を回復しました。IRESドメインIIAとNS5B NT8528⁻8543の間のこの長距離二重相互作用は、最適なウイルス複製に不可欠であると結論付けています。
The hepatitis C virus (HCV) genome contains structured elements thought to play important regulatory roles in viral RNA translation and replication processes. We used in vitro RNA binding assays to map interactions involving the HCV 5'UTR and distal sequences in NS5B to examine their impact on viral RNA replication. The data revealed that 5'UTR nucleotides (nt) 95⁻110 in the internal ribosome entry site (IRES) domain IIa and matching nt sequence 8528⁻8543 located in the RNA-dependent RNA polymerase coding region NS5B, form a high-affinity RNA-RNA complex in vitro. This duplex is composed of both wobble and Watson-Crick base-pairings, with the latter shown to be essential to the formation of the high-affinity duplex. HCV genomic RNA constructs containing mutations in domain IIa nt 95⁻110 or within the genomic RNA location comprising nt 8528⁻8543 displayed, on average, 5-fold less intracellular HCV RNA and 6-fold less infectious progeny virus. HCV genomic constructs containing complementary mutations for IRES domain IIa nt 95⁻110 and NS5B nt 8528⁻8543 restored intracellular HCV RNA and progeny virus titers to levels obtained for parental virus RNA. We conclude that this long-range duplex interaction between the IRES domain IIa and NS5B nt 8528⁻8543 is essential for optimal virus replication.
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