ウイルスで発見された複製関連転写産物の新しいクラス

DNA複製のプライミングとテロメラーゼ拡張のテンプレートの提供におけるRNA分子の役割は、何十年も知られています。それ以来、RNAプライマー形成の調節、複製起源（ORI）認識複合体の動員、複製フォークのアセンブリなど、複製の管理において多様な役割を果たすいくつかの転写が発見されました。ウイルストランスクリプトームに関する最近の研究では、ORIの近くにあるゲノム位置から表される複製関連（RA）RNAの新しいクラスが明らかになりました。それらの多くはORIと重複していますが、他のものは複製起点の近くで終了します。これらの新規転写産物は、タンパク質コードと非コードRNAの両方にすることができます。mRNAのオーバーラップ部分は、一般に、5'-非翻訳領域（UTRS）、または長いアイソフォームの3'-UTRのいずれかです。主に第3世代の長い読み取りシーケンスを使用して、さまざまなウイルスファミリーでいくつかのRARNAが特定されています。これらの転写産物のハイパー編集も説明されています。

The role of RNA molecules in the priming of DNA replication and in providing a template for telomerase extension has been known for decades. Since then, several transcripts have been discovered, which play diverse roles in governing replication, including regulation of RNA primer formation, the recruitment of replication origin (Ori) recognition complex, and the assembly of replication fork. Recent studies on viral transcriptomes have revealed novel classes of replication-associated (ra)RNAs, which are expressed from the genomic locations in close vicinity to the Ori. Many of them overlap the Ori, whereas others are terminated close to the replication origin. These novel transcripts can be both protein-coding and non-coding RNAs. The Ori-overlapping part of the mRNAs is generally either the 5'-untranslated regions (UTRs), or the 3'-UTRs of the longer isoforms. Several raRNAs have been identified in various viral families using primarily third-generation long-read sequencing. Hyper-editing of these transcripts has also been described.