すべてのボレリアのスピロケートの診断目的のための進化的保存DNA配列と対応するS21リボソームタンパク質領域の同定

すべてのBorrelia sp。ライムのロレリア症および他の疾患の原因はすでに特定されており、ヒト病原体として適切に分類されています。このため、すべてのBorrelia spを検出する診断ELISAテストを開発することは非常に重要です。この研究の目的は、現在知られているすべてのBorrelia sp。実験研究では、利用可能なBorrelia sp。進化的保存領域の存在について、ゲノムを整列させ、スクリーニングしました。バイオインフォマティクス分析の結果として、S21リボソームタンパク質のコアフラグメントをコードする進化的に保存されたDNA領域が同定されました。いくつかの属固有のPCRプライマーとS21タンパク質B細胞エピトープの両方が、前向き診断目的で設計されました。

It is still under investigation, whether all Borrelia sp. causing Lyme borreliosis and other diseases are already identified and properly classified as human pathogens. For this reason, it is of great importance to develop a diagnostic ELISA test that detects all Borrelia sp. The aim of this study was to identify conserved DNA and protein regions present in all currently known Borrelia sp. In experimental studies 31 available Borrelia sp. genomes were aligned and screened for the presence of evolutionary conserved regions. As a result of bioinformatics analysis, one evolutionally conserved DNA region encoding a core fragment of the S21 ribosomal protein was identified. Both a couple of genus-specific PCR primers and the S21 protein B-cell epitope were designed for prospective diagnostic purposes.