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Advances in virus research20190101Vol.103issue()

真核生物循環再エンコード一本鎖DNA(クレスDNA)ウイルス:小さなゲノムと多様な宿主範囲を備えたユビキタスウイルス

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文献タイプ:
  • Journal Article
  • Review
概要
Abstract

一本鎖DNA(SSDNA)はかつてウイルスの比較的まれなゲノムアーキテクチャであると考えられていましたが、最新のメタゲノミクスシーケンスは、ほとんどの環境および多様な宿主に関連して循環ssDNAウイルスを明らかにしました。特に、相同レプリケーション関連タンパク質(REP)をコードする円形のssDNAウイルスは、真核生物のスーパーグループの大部分で特定されており、ssDNAウイルス(CRESS DNA)ウイルスの生態学的効果と進化的歴史に関心があります。このレビューでは、過去10年間にわたる真核生物のクレスDNA分類群のシーケンスの多様性と拡大の爆発を調査し、ゲノムシーケンスを通じてのみ知られる新たに特定されたグループとの適切に研究されたジェミニビロスとサコビルスの類似性を強調し、真核生物のクレスの生態と進化の生態と進化を議論します。DNAウイルスは、将来の研究地平線について推測します。

一本鎖DNA(SSDNA)はかつてウイルスの比較的まれなゲノムアーキテクチャであると考えられていましたが、最新のメタゲノミクスシーケンスは、ほとんどの環境および多様な宿主に関連して循環ssDNAウイルスを明らかにしました。特に、相同レプリケーション関連タンパク質(REP)をコードする円形のssDNAウイルスは、真核生物のスーパーグループの大部分で特定されており、ssDNAウイルス(CRESS DNA)ウイルスの生態学的効果と進化的歴史に関心があります。このレビューでは、過去10年間にわたる真核生物のクレスDNA分類群のシーケンスの多様性と拡大の爆発を調査し、ゲノムシーケンスを通じてのみ知られる新たに特定されたグループとの適切に研究されたジェミニビロスとサコビルスの類似性を強調し、真核生物のクレスの生態と進化の生態と進化を議論します。DNAウイルスは、将来の研究地平線について推測します。

While single-stranded DNA (ssDNA) was once thought to be a relatively rare genomic architecture for viruses, modern metagenomics sequencing has revealed circular ssDNA viruses in most environments and in association with diverse hosts. In particular, circular ssDNA viruses encoding a homologous replication-associated protein (Rep) have been identified in the majority of eukaryotic supergroups, generating interest in the ecological effects and evolutionary history of circular Rep-encoding ssDNA viruses (CRESS DNA) viruses. This review surveys the explosion of sequence diversity and expansion of eukaryotic CRESS DNA taxonomic groups over the last decade, highlights similarities between the well-studied geminiviruses and circoviruses with newly identified groups known only through their genome sequences, discusses the ecology and evolution of eukaryotic CRESS DNA viruses, and speculates on future research horizons.

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